chromosome 19 open reading frame 40

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同義遺伝子名

chromosome 19 open reading frame 40, FLJ46828, MGC32020, C19orf40

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:5.90

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:5.90

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:4.80

GeneChip

大脳:5.66

小脳:6.01

脳幹:5.56

脳梁:5.78

松果体:-

末梢神経:5.38

脊柱:5.53

網膜:-

目:-

動脈:5.69

静脈:5.87

リンパ節:5.94

末梢血:-

脾臓:5.77

胸腺:6.09

骨髄:5.77

脂肪:5.52

骨:-

皮膚:5.92

CAGE

大脳:0.42

小脳:-

脳幹:0.68

脳梁:0.63

松果体:0.47

末梢神経:-

脊柱:0.73

網膜:-

目:-

動脈:0

静脈:1.10

リンパ節:1.04

末梢血:-

脾臓:1.15

胸腺:1.29

骨髄:-

脂肪:0.78

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.18

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.63

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.74

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:18.20

胎盤:-

前立腺:11.30

卵巣:-

精巣:13

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:10.60

肺:9.80

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:5.77

胎盤:5.40

前立腺:5.50

卵巣:5.88

精巣:6.41

心臓:5.78

骨格筋:5.76

食道:5.85

胃:5.71

腸:5.75

結腸:5.84

肝臓:5.80

肺:5.83

膀胱:-

腎臓:5.66

下垂体:5.46

甲状腺:5.55

副腎:5.80

膵臓:5.43

乳腺:5.81

唾液腺:5.85

CAGE

子宮:0.75

胎盤:1.14

前立腺:0.62

卵巣:0.72

精巣:2.08

心臓:0.36

骨格筋:0.13

食道:1.04

胃:-

腸:1.02

結腸:0.89

肝臓:0.55

肺:0.31

膀胱:0.53

腎臓:0.92

下垂体:0.10

甲状腺:0.53

副腎:-

膵臓:0.58

乳腺:0.55

唾液腺:0.83

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.76

卵巣:0.76

精巣:2.10

心臓:0.32

骨格筋:0.11

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.53

肝臓:0.19

肺:0.12

膀胱:-

腎臓:0.40

下垂体:-

甲状腺:0.72

副腎:1.18

膵臓:-

乳腺:0.84

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_152266
Gene ID	91442
Unigene ID	Hs.579899
Probe set ID	214816_x_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000131944
GTEx ID	ENSG00000131944

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_178643
ラット[1]	NM_001109335

染色体

19q13.11 [33,463,148 - 33,467,946]

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遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed (Pubmed ID)

12477932
15489334
16344560
17207965
17289582
18029348
18174376
18206976
18285517
18995830
20064461
20347428
20347429
20670894
21832049
22705371
23333308
23741361
23932590
23999858
24003026

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

GO:0043240	Fanconi anaemia nuclear complex
GO:0043231	intracellular membrane-bounded organelle
GO:0005730	nucleolus
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0003682	chromatin binding
GO:0003677	DNA binding
GO:0005515	protein binding