CTD (carboxy-terminal domain, RNA polymerase II, polypeptide A) phosphatase, subunit 1

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同義遺伝子名

CTDP1, TFIIF-associating CTD phosphatase, CCFDN, FCP1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:9.50

小脳:25.20

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:30.70

脊柱:112.30

網膜:-

目:29.40

動脈:-

静脈:66.60

リンパ節:60.70

末梢血:-

脾臓:37.80

胸腺:-

骨髄:78.70

脂肪:-

骨:12.80

皮膚:24

GeneChip

大脳:6.15

小脳:6.18

脳幹:6.22

脳梁:6.17

松果体:-

末梢神経:5.82

脊柱:6

網膜:-

目:-

動脈:6.26

静脈:6.28

リンパ節:6.24

末梢血:-

脾臓:6.28

胸腺:6.67

骨髄:6.42

脂肪:6.13

骨:-

皮膚:6.50

CAGE

大脳:2.56

小脳:-

脳幹:2.87

脳梁:3.12

松果体:2.13

末梢神経:-

脊柱:2.40

網膜:-

目:-

動脈:2.99

静脈:2.87

リンパ節:3.12

末梢血:-

脾臓:3.07

胸腺:3.48

骨髄:-

脂肪:2.79

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.41

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.69

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.87

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:36.50

胎盤:18.20

前立腺:-

卵巣:-

精巣:69.20

心臓:12.80

骨格筋:-

食道:-

胃:42.50

腸:-

結腸:17

肝臓:-

肺:14.70

膀胱:-

腎臓:20.80

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:88.90

乳腺:37.20

唾液腺:-

GeneChip

子宮:6.17

胎盤:6.23

前立腺:6.28

卵巣:6.22

精巣:7.25

心臓:6.07

骨格筋:6.25

食道:6.41

胃:6.14

腸:6.31

結腸:6.44

肝臓:6.22

肺:6.27

膀胱:-

腎臓:6.33

下垂体:6.24

甲状腺:6.32

副腎:6.31

膵臓:6.33

乳腺:6.23

唾液腺:6.19

CAGE

子宮:2.68

胎盤:2.75

前立腺:2.48

卵巣:2.56

精巣:3.63

心臓:2.39

骨格筋:2.40

食道:2.67

胃:-

腸:2.98

結腸:2.78

肝臓:2.87

肺:2.75

膀胱:2.54

腎臓:2.67

下垂体:2.05

甲状腺:2.67

副腎:-

膵臓:2.41

乳腺:2.69

唾液腺:2.60

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.49

卵巣:0.66

精巣:0.57

心臓:0.27

骨格筋:0.19

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.37

肝臓:0.14

肺:0.49

膀胱:-

腎臓:0.60

下垂体:-

甲状腺:1.38

副腎:1.08

膵臓:-

乳腺:0.70

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_048368
Gene ID	9150
Unigene ID	Hs.465490
Probe set ID	205035_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000060069
GTEx ID	ENSG00000060069

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_026295
ラット[1]	NM_001106131

染色体

18q23 [77,439,801 - 77,514,510]

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- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR011947	FCP1-like phosphatase, phosphatase domain
IPR004274	NLI interacting factor

GO:0051301	cell division
GO:0010458	exit from mitosis
GO:0010467	gene expression
GO:0050434	positive regulation of viral transcription
GO:0006470	protein amino acid dephosphorylation
GO:0006368	RNA elongation from RNA polymerase II promoter
GO:0006366	transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0016032	viral reproduction

GO:0015629	actin cytoskeleton
GO:0005813	centrosome
GO:0005737	cytoplasm
GO:0030496	midbody
GO:0005730	nucleolus
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus
GO:0005819	spindle
GO:0051233	spindle midzone
GO:0000922	spindle pole

GO:0008420	CTD phosphatase activity
GO:0003899	DNA-directed RNA polymerase activity

CTD (carboxy-terminal domain, RNA polymerase II, polypeptide A) phosphatase, subunit 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function