leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 1

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同義遺伝子名

LRR FLII-interacting protein 1, MGC10947, LRRFIP1, GCF2, GCF-2, HUFI-1, MGC119739, FLIIAP1, TRIP, FLAP-1, GC-binding factor 2, TAR RNA-interacting protein, MGC119738

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:30.80 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:92 脊柱:- 網膜:593.20 目:58.80 動脈:119.90 静脈:- リンパ節:212.30 末梢血:54.70 脾臓:56.70 胸腺:128.80 骨髄:216.50 脂肪:80.70 骨:64 皮膚:153.60
GeneChip 大脳:5.04 小脳:4.27 脳幹:4.83 脳梁:5.46 松果体:- 末梢神経:6.30 脊柱:6.40 網膜:- 目:- 動脈:8.13 静脈:8.78 リンパ節:8.70 末梢血:- 脾臓:9.19 胸腺:9.09 骨髄:8.94 脂肪:6.90 骨:- 皮膚:8.52
CAGE 大脳:3.03 小脳:- 脳幹:2.74 脳梁:2.66 松果体:3.04 末梢神経:- 脊柱:3.12 網膜:- 目:- 動脈:4.90 静脈:4.10 リンパ節:3.93 末梢血:- 脾臓:4.13 胸腺:3.99 骨髄:- 脂肪:4.17 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.00 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.16 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.30 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:145.80 胎盤:87.40 前立腺:101.40 卵巣:111.80 精巣:21.60 心臓:153.30 骨格筋:100.50 食道:- 胃:127.50 腸:32.40 結腸:178.10     肝臓:190        肺:146.60    膀胱:- 腎臓:135.20 下垂体:- 甲状腺:655 副腎:- 膵臓:17.80 乳腺:297.40 唾液腺:-
GeneChip 子宮:8.14 胎盤:7.46 前立腺:8.68 卵巣:8.04 精巣:5.23 心臓:7.30 骨格筋:6.38 食道:9.20 胃:8.39 腸:7.77 結腸:7.29 肝臓:8.16 肺:9.46 膀胱:- 腎臓:7.97 下垂体:6.65 甲状腺:8.26 副腎:7.29 膵臓:7.09 乳腺:8.49 唾液腺:8.46
CAGE 子宮:4.24 胎盤:3.55 前立腺:4.20 卵巣:3.77 精巣:2.63 心臓:4.40 骨格筋:4.57 食道:4.28 胃:- 腸:3.67 結腸:3.84     肝臓:4.01    肺:4.41 膀胱:4.74 腎臓:4.25 下垂体:3.59 甲状腺:3.73 副腎:- 膵臓:2.86 乳腺:4.30 唾液腺:3.37
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:4.14 卵巣:1.29 精巣:2.31 心臓:1.30 骨格筋:1.02 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:4.58     肝臓:0.05        肺:1.29    膀胱:- 腎臓:1.56 下垂体:- 甲状腺:2.35 副腎:3.25 膵臓:- 乳腺:1.61 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001137552
Gene ID 9208
Unigene ID Hs.471779
Probe set ID 201862_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000124831
GTEx ID ENSG00000124831

オーソログ対応遺伝子

マウス[8]  NM_001111311, NM_001111312, NM_008515
ラット[1]  NM_001014269, NM_001111312, NM_008515

染色体

2q37.3  [238,536,219  -  238,722,325]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
9525888
9671805
9705290
10364563
10366446
12477932
14522076
14702039
15302935
15489334
15815621
16199883
16964243
16990252
17081983
19265123
20379614
20833976
21102652
22739583
22750095
22863883
22939629
23099021
23505185
24457600
24567534
24639526
24690174
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0008150  biological_process
GO:0045087  innate immune response
GO:0045892  negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0032481  positive regulation of type I interferon production
GO:0006357  regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005575  cellular_component
GO:0005737  cytoplasm
GO:0005856  cytoskeleton
GO:0005829  cytosol
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0003677  DNA binding
GO:0003725  double-stranded RNA binding
GO:0003674  molecular_function
GO:0005515  protein binding
GO:0042803  protein homodimerization activity