protocadherin 21

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同義遺伝子名

PCDH21, KIAA1775, DKFZp434A132, protocadherin 21

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:21.30

小脳:12.60

脳幹:-

脳梁:-

松果体:741.70

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:118.60

目:335

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:18.90

胸腺:12.90

骨髄:-

脂肪:-

骨:12.80

皮膚:24

GeneChip

大脳:5.47

小脳:4.92

脳幹:5.57

脳梁:4.95

松果体:-

末梢神経:5.16

脊柱:4.93

網膜:-

目:-

動脈:4.87

静脈:4.77

リンパ節:4.92

末梢血:-

脾臓:5.52

胸腺:5.19

骨髄:4.72

脂肪:4.96

骨:-

皮膚:7.64

CAGE

大脳:2.58

小脳:-

脳幹:2.30

脳梁:1.99

松果体:5.03

末梢神経:-

脊柱:1.23

網膜:-

目:-

動脈:0.47

静脈:1.23

リンパ節:1.08

末梢血:-

脾臓:1.21

胸腺:1.93

骨髄:-

脂肪:0.14

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:1.12

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.82

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.04

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:64.80

結腸:127.20

肝臓:-

肺:-

膀胱:-

腎臓:31.20

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:18.60

唾液腺:-

GeneChip

子宮:4.74

胎盤:4.32

前立腺:4.68

卵巣:4.63

精巣:4.49

心臓:4.52

骨格筋:4.65

食道:5.68

胃:4.61

腸:4.74

結腸:6.34

肝臓:4.78

肺:4.75

膀胱:-

腎臓:4.67

下垂体:4.85

甲状腺:4.60

副腎:4.66

膵臓:4.73

乳腺:5.54

唾液腺:4.53

CAGE

子宮:0.71

胎盤:0.24

前立腺:0.70

卵巣:0.52

精巣:0.71

心臓:0.84

骨格筋:0.05

食道:2.54

胃:-

腸:0.77

結腸:3.20

肝臓:0.14

肺:0.31

膀胱:0.09

腎臓:0.82

下垂体:0.66

甲状腺:0.23

副腎:-

膵臓:0

乳腺:0

唾液腺:0.36

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.23

卵巣:0.43

精巣:0.17

心臓:0.06

骨格筋:0

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:1.37

肝臓:0.02

肺:0.12

膀胱:-

腎臓:0.49

下垂体:-

甲状腺:0.01

副腎:0.67

膵臓:-

乳腺:0.01

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_033100
Gene ID	92211
Unigene ID	Hs.137556
Probe set ID	213369_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000148600
GTEx ID	ENSG00000148600

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_130878
ラット[1]	NM_053572

染色体

10q23.1 [85,954,410 - 85,979,377]

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- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR002126	Cadherin
IPR015919	Cadherin-like

Link to Pubmed (Pubmed ID)

8889548
11597768
12477932
16288196
16344560
16385451
18654668
20087419
20498078
20805371
21697133
21875946
23044944
23233793
24265541

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0007156	homophilic cell adhesion
GO:0045494	photoreceptor cell maintenance

Cellular Component

GO:0005887	integral to plasma membrane
GO:0042622	photoreceptor outer segment membrane

Molecular Function

calcium ion binding