splicing factor, arginine/serine-rich 11

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同義遺伝子名

p54, Arginine-rich 54 kDa nuclear protein, dJ677H15.2, DKFZp686M13204, splicing factor, arginine/serine-rich 11, Splicing factor arginine/serine-rich 11, SFRS11

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:120.90 小脳:113.30 脳幹:- 脳梁:175 松果体:- 末梢神経:276 脊柱:- 網膜:355.90 目:129.30 動脈:119.90 静脈:- リンパ節:232.50 末梢血:54.70 脾臓:113.40 胸腺:322.10 骨髄:157.40 脂肪:282.30 骨:115.20 皮膚:100.80
GeneChip 大脳:8.87 小脳:9.01 脳幹:8.77 脳梁:9.14 松果体:- 末梢神経:8.95 脊柱:9.02 網膜:- 目:- 動脈:9.51 静脈:9.02 リンパ節:9.86 末梢血:- 脾臓:9.70 胸腺:10.40 骨髄:9.07 脂肪:9.23 骨:- 皮膚:9.36
CAGE 大脳:4.74 小脳:- 脳幹:4.83 脳梁:4.58 松果体:4.85 末梢神経:- 脊柱:4.77 網膜:- 目:- 動脈:4.47 静脈:4.53 リンパ節:4.35 末梢血:- 脾臓:4.30 胸腺:4.66 骨髄:- 脂肪:4.32 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:4.29 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:4.45 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:4.06 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:236.90 胎盤:156.70 前立腺:123.90 卵巣:111.80 精巣:203.30 心臓:140.50 骨格筋:120.50 食道:- 胃:233.70 腸:291.60 結腸:76.30     肝臓:232.20        肺:332.40    膀胱:502.40 腎臓:104 下垂体:232 甲状腺:- 副腎:304.70 膵臓:133.40 乳腺:204.40 唾液腺:-
GeneChip 子宮:9.80 胎盤:9.53 前立腺:9.83 卵巣:9.75 精巣:9.69 心臓:8.64 骨格筋:8.62 食道:9.02 胃:9.26 腸:8.68 結腸:7.67 肝臓:9.64 肺:9.34 膀胱:- 腎臓:8.68 下垂体:9.76 甲状腺:9.78 副腎:9.45 膵臓:7.93 乳腺:9.29 唾液腺:9.02
CAGE 子宮:4.71 胎盤:4.48 前立腺:4.50 卵巣:4.32 精巣:4.57 心臓:4.30 骨格筋:4.38 食道:4.32 胃:- 腸:4.32 結腸:4.33     肝臓:4.07    肺:4.42 膀胱:4.50 腎臓:4.31 下垂体:5.06 甲状腺:4.43 副腎:- 膵臓:4.16 乳腺:4.57 唾液腺:4.13
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:4.81 卵巣:4.73 精巣:4.56 心臓:3.45 骨格筋:3.63 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:4.14     肝臓:3.32        肺:4.75    膀胱:- 腎臓:4.79 下垂体:- 甲状腺:5.11 副腎:5.01 膵臓:- 乳腺:4.57 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_004768
Gene ID 9295
Unigene ID Hs.479693
Probe set ID 200686_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000116754
GTEx ID ENSG00000116754

オーソログ対応遺伝子

マウス[6]  NM_001093752, NM_001093753, NM_026989
ラット [0]  

染色体

1p31.1  [70,671,365  -  70,718,735]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000504  RNA recognition motif, RNP-1

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1896467
8816452
9756848
10606266
12226669
12477932
14702039
14729963
16055720
16943417
17081983
17342744
17353931
17361132
18029348
18832053
19857271
20379614
20516191
20811636
21139048
21145461
21890473
21963094
21988832
22094256
22113938
22379092
22939629
23000965
23383273
24250222
24583282
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0010467  gene expression
GO:0031124  mRNA 3'-end processing
GO:0006406  mRNA export from nucleus
GO:0006397  mRNA processing
GO:0000398  nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0008380  RNA splicing
GO:0006369  termination of RNA polymerase II transcription
GO:0006366  transcription from RNA polymerase II promoter

Cellular Component

GO:0005730  nucleolus
GO:0005654  nucleoplasm
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0000166  nucleotide binding
GO:0005515  protein binding
GO:0003723  RNA binding