CCR4-NOT transcription complex, subunit 8

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同義遺伝子名

CCR4-NOT transcription complex subunit 8, CNOT8, hCAF1, CCR4-NOT transcription complex, subunit 8, CALIFp, CCR4-associated factor 8, CAF1-like protein, CAF2, CALIF

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:- 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:23.50 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:18.90 胸腺:12.90 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:14.40
GeneChip 大脳:6.12 小脳:5.87 脳幹:5.95 脳梁:6.34 松果体:- 末梢神経:6.03 脊柱:6.40 網膜:- 目:- 動脈:6.07 静脈:6.35 リンパ節:6.78 末梢血:- 脾臓:7.04 胸腺:7.60 骨髄:6.67 脂肪:6.38 骨:- 皮膚:6.59
CAGE 大脳:3.42 小脳:- 脳幹:3.57 脳梁:3.45 松果体:3.41 末梢神経:- 脊柱:3.67 網膜:- 目:- 動脈:3.71 静脈:3.57 リンパ節:3.63 末梢血:- 脾臓:3.47 胸腺:3.90 骨髄:- 脂肪:3.83 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:4.56 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:5.01 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:4.82 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:7.30 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:849.70 腸:- 結腸:118.70     肝臓:-        肺:73.30    膀胱:125.60 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.69 胎盤:6.40 前立腺:6.49 卵巣:6.61 精巣:6.13 心臓:6.08 骨格筋:5.47 食道:6.07 胃:6.19 腸:6.10 結腸:6.40 肝臓:5.78 肺:6.96 膀胱:- 腎臓:5.92 下垂体:5.19 甲状腺:6.63 副腎:6.35 膵臓:5.39 乳腺:6.69 唾液腺:6.47
CAGE 子宮:3.17 胎盤:3.12 前立腺:3.24 卵巣:3.13 精巣:3.48 心臓:3.31 骨格筋:3.00 食道:3.25 胃:- 腸:3.43 結腸:3.49     肝臓:2.79    肺:3.94 膀胱:3.56 腎臓:3.00 下垂体:3.19 甲状腺:3.86 副腎:- 膵臓:3.02 乳腺:3.71 唾液腺:3.15
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:4.74 卵巣:4.36 精巣:5.11 心臓:3.66 骨格筋:3.21 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:4.93     肝臓:3.31        肺:5.39    膀胱:- 腎臓:4.40 下垂体:- 甲状腺:4.62 副腎:4.92 膵臓:- 乳腺:4.69 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_004779
Gene ID 9337
Unigene ID Hs.267038
Probe set ID 202163_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000155508
GTEx ID ENSG00000155508

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_026949
ラット[1]  NM_001008382

染色体

5q33.2  [154,237,113  -  154,256,353]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9820826
10036195
10637334
11076863
11136725
11230166
11256614
12477932
12771185
14702039
15489334
15489336
15769875
16381901
16778766
17178784
17264152
17353931
19322201
19558367
19605561
20065043
20360068
20595389
20595394
21139048
21336257
21890473
21900206
21906983
21963094
21987572
22505724
22683897
22977175
23236473
23383273
24036545
24115769

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0043928  exonucleolytic nuclear-transcribed mRNA catabolic process involved in deadenylation-dependent decay
GO:0010467  gene expression
GO:0035195  gene silencing by miRNA
GO:0016071  mRNA metabolic process
GO:0008285  negative regulation of cell proliferation
GO:0000288  nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay
GO:0000289  nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening
GO:0008284  positive regulation of cell proliferation
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006417  regulation of translation
GO:0016070  RNA metabolic process
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0030014  CCR4-NOT complex
GO:0005829  cytosol
GO:0005622  intracellular
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0000175  3'-5'-exoribonuclease activity
GO:0046872  metal ion binding
GO:0004535  poly(A)-specific ribonuclease activity
GO:0005515  protein binding
GO:0003723  RNA binding
GO:0003700  transcription factor activity