carbohydrate (chondroitin 6) sulfotransferase 3

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同義遺伝子名

C6ST1, carbohydrate (chondroitin 6) sulfotransferase 3, Chondroitin 6-sulfotransferase, Chondroitin 6-O-sulfotransferase 1, CHST3, GST-0, Carbohydrate sulfotransferase 3, C6ST-1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:13 小脳:12.60 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:30.70 脊柱:- 網膜:- 目:47 動脈:30 静脈:199.90 リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:12.90 骨髄:- 脂肪:40.30 骨:89.60 皮膚:43.20
GeneChip 大脳:4.44 小脳:4.46 脳幹:4.46 脳梁:4.46 松果体:- 末梢神経:4.43 脊柱:4.31 網膜:- 目:- 動脈:4.43 静脈:4.72 リンパ節:4.31 末梢血:- 脾臓:4.12 胸腺:4.11 骨髄:4.59 脂肪:4.59 骨:- 皮膚:4.65
CAGE 大脳:2.70 小脳:- 脳幹:3.46 脳梁:3.55 松果体:1.38 末梢神経:- 脊柱:3.63 網膜:- 目:- 動脈:3.42 静脈:2.35 リンパ節:1.48 末梢血:- 脾臓:1.79 胸腺:0.86 骨髄:- 脂肪:3.00 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.82 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.24 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.86 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:9.10 胎盤:14.60 前立腺:22.50 卵巣:37.30 精巣:38.90 心臓:- 骨格筋:- 食道:342.80 胃:21.20 腸:- 結腸:8.50     肝臓:10.60        肺:19.60    膀胱:- 腎臓:10.40 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:18.60 唾液腺:-
GeneChip 子宮:4.30 胎盤:4.29 前立腺:4.21 卵巣:4.49 精巣:4.35 心臓:4.40 骨格筋:4.43 食道:4.39 胃:4.28 腸:4.36 結腸:4.50 肝臓:4.32 肺:4.25 膀胱:- 腎臓:4.48 下垂体:4.50 甲状腺:4.34 副腎:4.31 膵臓:4.87 乳腺:4.29 唾液腺:4.37
CAGE 子宮:2.99 胎盤:2.33 前立腺:2.89 卵巣:3.46 精巣:3.33 心臓:3.12 骨格筋:3.03 食道:2.52 胃:- 腸:1.53 結腸:1.86     肝臓:0.90    肺:2.29 膀胱:2.68 腎臓:2.37 下垂体:1.93 甲状腺:2.12 副腎:- 膵臓:1.42 乳腺:3.12 唾液腺:2.12
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.10 卵巣:3.86 精巣:3.58 心臓:2.60 骨格筋:1.96 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.84     肝臓:0.72        肺:2.36    膀胱:- 腎臓:2.50 下垂体:- 甲状腺:2.34 副腎:2.12 膵臓:- 乳腺:2.87 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_004273
Gene ID 9469
Unigene ID Hs.158304
Probe set ID 208252_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000122863
GTEx ID ENSG00000122863

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_016803
ラット[1]  NM_053408

染色体

10q22.1  [73,724,123  -  73,773,322]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR016469  Carbohydrate sulfotransferase
IPR000863  Sulfotransferase domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1433500
8419650
9714738
9883891
11056388
11696535
12477932
15215498
15489334
16344560
16385451
18398821
18513679
18697746
19320654
19322201
19343046
20301308
20301725
20830804
21882400
21963094
22246436
24216480

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0005975  carbohydrate metabolic process
GO:0030206  chondroitin sulfate biosynthetic process
GO:0030204  chondroitin sulfate metabolic process
GO:0030203  glycosaminoglycan metabolic process
GO:0006790  sulfur metabolic process
GO:0043029  T cell homeostasis

Cellular Component

GO:0000139  Golgi membrane
GO:0016021  integral to membrane

Molecular Function

GO:0008459  chondroitin 6-sulfotransferase activity
GO:0050698  proteoglycan sulfotransferase activity
GO:0008146  sulfotransferase activity