serine palmitoyltransferase, long chain base subunit 2

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同義遺伝子名

LCB 2, SPT 2, SPTLC2, SPT2, KIAA0526, Long chain base biosynthesis protein 2, LCB2, Serine palmitoyltransferase 2, Serine-palmitoyl-CoA transferase 2

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:53.30 小脳:12.60 脳幹:- 脳梁:- 松果体:445 末梢神経:61.30 脊柱:224.60 網膜:- 目:23.50 動脈:- 静脈:- リンパ節:80.90 末梢血:18.20 脾臓:37.80 胸腺:51.50 骨髄:354.20 脂肪:40.30 骨:38.40 皮膚:120
GeneChip 大脳:6.24 小脳:5.62 脳幹:6.37 脳梁:7.12 松果体:- 末梢神経:6.44 脊柱:6.70 網膜:- 目:- 動脈:6.52 静脈:6.49 リンパ節:6.80 末梢血:- 脾臓:6.74 胸腺:6.33 骨髄:7.66 脂肪:6.87 骨:- 皮膚:6.78
CAGE 大脳:3.99 小脳:- 脳幹:4.58 脳梁:4.85 松果体:3.85 末梢神経:- 脊柱:4.65 網膜:- 目:- 動脈:3.58 静脈:4.01 リンパ節:4.09 末梢血:- 脾臓:4.53 胸腺:3.54 骨髄:- 脂肪:4.79 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:3.64 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:3.42 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:5.14 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:72.90 胎盤:61.90 前立腺:56.30 卵巣:37.30 精巣:21.60 心臓:76.60 骨格筋:20.10 食道:- 胃:276.10 腸:32.40 結腸:118.70     肝臓:21.10        肺:68.40    膀胱:- 腎臓:114.40 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:17.80 乳腺:185.90 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.54 胎盤:6.39 前立腺:6.40 卵巣:6.48 精巣:6.14 心臓:6.35 骨格筋:6.07 食道:7.62 胃:6.46 腸:6.56 結腸:6.67 肝臓:6.20 肺:6.69 膀胱:- 腎臓:6.44 下垂体:6.28 甲状腺:6.06 副腎:6.35 膵臓:6.42 乳腺:6.60 唾液腺:6.41
CAGE 子宮:3.66 胎盤:3.81 前立腺:3.43 卵巣:3.47 精巣:3.12 心臓:3.70 骨格筋:3.14 食道:3.94 胃:- 腸:3.85 結腸:4.18     肝臓:3.01    肺:4.04 膀胱:3.51 腎臓:3.90 下垂体:3.55 甲状腺:3.30 副腎:- 膵臓:3.06 乳腺:4.74 唾液腺:3.70
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.01 卵巣:3.47 精巣:3.17 心臓:2.23 骨格筋:1.74 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:3.74     肝臓:1.78        肺:3.13    膀胱:- 腎臓:3.45 下垂体:- 甲状腺:2.48 副腎:3.48 膵臓:- 乳腺:3.41 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_004863
Gene ID 9517
Unigene ID Hs.435661
Probe set ID 203127_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000100596
GTEx ID ENSG00000100596

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_011479
ラット[1]  NM_001037097

染色体

14q24.3  [77,972,340  -  78,083,116]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

7506601
8889549
8921873
9363775
9628581
10722674
10737800
12207934
12445191
12477932
12508121
15489334
16147992
17081983
17194770
17331073
19416851
20877624
20920666
21139048
21890473
21906983
23025307
23658386
24175284

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0046513  ceramide biosynthetic process
GO:0046511  sphinganine biosynthetic process
GO:0030148  sphingolipid biosynthetic process
GO:0006665  sphingolipid metabolic process
GO:0006686  sphingomyelin biosynthetic process
GO:0046512  sphingosine biosynthetic process

Cellular Component

GO:0005789  endoplasmic reticulum membrane
GO:0016021  integral to membrane
GO:0005739  mitochondrion
GO:0017059  serine C-palmitoyltransferase complex

Molecular Function

GO:0030170  pyridoxal phosphate binding
GO:0004758  serine C-palmitoyltransferase activity