RNA binding motif protein 39

同義遺伝子名

Splicing factor HCC1, RNA-binding region-containing protein 2, DKFZp781C0423, Hepatocellular carcinoma protein 1, RNPC2, CAPER, CC1.3, FLJ44170, RBM39, RNA binding motif protein 39, CAPERalpha

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:263.10

小脳:277.10

脳幹:-

脳梁:408.30

松果体:-

末梢神経:184

脊柱:112.30

網膜:237.30

目:176.30

動脈:509.60

静脈:133.30

リンパ節:171.90

末梢血:309.70

脾臓:510.50

胸腺:605.50

骨髄:177.10

脂肪:564.70

骨:140.70

皮膚:187.20

GeneChip

大脳:7.79

小脳:8.33

脳幹:7.95

脳梁:8.24

松果体:-

末梢神経:7.97

脊柱:7.90

網膜:-

目:-

動脈:8.26

静脈:7.93

リンパ節:9.04

末梢血:-

脾臓:8.92

胸腺:9.50

骨髄:8.47

脂肪:8.43

骨:-

皮膚:8.31

CAGE

大脳:5.43

小脳:-

脳幹:5.30

脳梁:5.22

松果体:5.87

末梢神経:-

脊柱:5.72

網膜:-

目:-

動脈:5.24

静脈:5.37

リンパ節:5.25

末梢血:-

脾臓:5.28

胸腺:5.54

骨髄:-

脂肪:5.35

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.28

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:4.26

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:3.42

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:546.80

胎盤:204

前立腺:146.40

卵巣:186.30

精巣:229.30

心臓:140.50

骨格筋:180.80

食道:-

胃:233.70

腸:259.20

結腸:339.20

肝臓:453.90

肺:263.90

膀胱:879.30

腎臓:166.40

下垂体:347.90

甲状腺:327.50

副腎:253.90

膵臓:195.60

乳腺:260.20

唾液腺:985.20

GeneChip

子宮:8.94

胎盤:9

前立腺:8.99

卵巣:8.95

精巣:7.84

心臓:8.07

骨格筋:7.86

食道:8.17

胃:8.47

腸:8.21

結腸:7.55

肝臓:8.28

肺:8.68

膀胱:-

腎臓:8.03

下垂体:8.57

甲状腺:8.77

副腎:8.51

膵臓:7.67

乳腺:8.19

唾液腺:8.10

CAGE

子宮:5.74

胎盤:5.50

前立腺:5.52

卵巣:5.40

精巣:4.76

心臓:5.30

骨格筋:5.31

食道:5.34

胃:-

腸:5.18

結腸:5.32

肝臓:4.68

肺:5.45

膀胱:5.47

腎臓:5.10

下垂体:5.90

甲状腺:5.41

副腎:-

膵臓:5.23

乳腺:5.47

唾液腺:5.29

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:4.56

卵巣:4.89

精巣:4.04

心臓:3.08

骨格筋:1.47

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:4.41

肝臓:2.76

肺:4.74

膀胱:-

腎臓:4.76

下垂体:-

甲状腺:4.71

副腎:3.93

膵臓:-

乳腺:3.49

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_004902
Gene ID	9584
Unigene ID	Hs.282901
Probe set ID	208720_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000131051
GTEx ID	ENSG00000131051

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]	NM_133242
ラット[1]	NM_001013207

染色体

20q11.22 [34,291,531 - 34,330,234]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000504	RNA recognition motif, RNP-1
IPR003954	RNA recognition, domain 1

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0006397	mRNA processing
GO:0006355	regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006396	RNA processing
GO:0008380	RNA splicing
GO:0006351	transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005813	centrosome
GO:0015630	microtubule cytoskeleton
GO:0016607	nuclear speck
GO:0005730	nucleolus
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0000166	nucleotide binding
GO:0005515	protein binding
GO:0003723	RNA binding

RNA binding motif protein 39

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function