lysine (K)-specific demethylase 4A

同義遺伝子名

KIAA0677, JHDM3A, JMJD2, Jumonji domain-containing protein 2A, JMJD2A, jumonji domain containing 2A, jumonji domain containing 2

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:13

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:112.30

網膜:118.60

目:70.50

動脈:-

静脈:66.60

リンパ節:60.70

末梢血:18.20

脾臓:56.70

胸腺:12.90

骨髄:-

脂肪:40.30

骨:12.80

皮膚:28.80

GeneChip

大脳:6.56

小脳:6.42

脳幹:6.49

脳梁:6.39

松果体:-

末梢神経:6.48

脊柱:6.35

網膜:-

目:-

動脈:6.46

静脈:6.38

リンパ節:6.62

末梢血:-

脾臓:6.85

胸腺:6.77

骨髄:6.59

脂肪:6.63

骨:-

皮膚:6.42

CAGE

大脳:3.12

小脳:-

脳幹:3.20

脳梁:3.38

松果体:3.33

末梢神経:-

脊柱:2.96

網膜:-

目:-

動脈:2.96

静脈:3.11

リンパ節:3.18

末梢血:-

脾臓:3.15

胸腺:3.56

骨髄:-

脂肪:2.91

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:2.44

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.99

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:2.52

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:36.50

胎盤:21.90

前立腺:78.90

卵巣:74.50

精巣:13

心臓:25.50

骨格筋:20.10

食道:-

胃:-

腸:64.80

結腸:33.90

肝臓:21.10

肺:19.60

膀胱:-

腎臓:20.80

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:101.60

膵臓:35.60

乳腺:83.60

唾液腺:-

GeneChip

子宮:6.69

胎盤:6.05

前立腺:6.66

卵巣:6.60

精巣:6.05

心臓:6.40

骨格筋:6.44

食道:6.58

胃:6.91

腸:6.46

結腸:6.86

肝臓:6.68

肺:6.55

膀胱:-

腎臓:6.67

下垂体:6.75

甲状腺:6.79

副腎:6.98

膵臓:5.53

乳腺:6.60

唾液腺:6.64

CAGE

子宮:3.22

胎盤:2.91

前立腺:2.98

卵巣:3.04

精巣:2.59

心臓:2.59

骨格筋:2.39

食道:3.06

胃:-

腸:3.45

結腸:3.42

肝臓:2.88

肺:2.95

膀胱:2.65

腎臓:2.93

下垂体:3.18

甲状腺:3.09

副腎:-

膵臓:2.98

乳腺:3.02

唾液腺:3.24

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:3.16

卵巣:3.54

精巣:2.85

心臓:2.12

骨格筋:2.16

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.46

肝臓:2.05

肺:2.11

膀胱:-

腎臓:2.93

下垂体:-

甲状腺:3.09

副腎:3.14

膵臓:-

乳腺:2.96

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_014663
Gene ID	9682
Unigene ID	Hs.155983
Probe set ID	203204_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000066135
GTEx ID	ENSG00000066135

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_001161823, NM_172382
ラット[1]	NM_001107966, NM_172382

染色体

1p34.1 [44,115,829 - 44,171,186]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003347	Transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase
IPR002999	Tudor domain
IPR001965	Zinc finger, PHD-type

GO:0014898	cardiac muscle hypertrophy in response to stress
GO:0016577	histone demethylation
GO:0070544	histone H3-K36 demethylation
GO:0045892	negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351	transcription, DNA-dependent
GO:0019048	virus-host interaction

GO:0005813	centrosome
GO:0005737	cytoplasm
GO:0005730	nucleolus
GO:0005634	nucleus

GO:0051864	histone demethylase activity (H3-K36 specific)
GO:0035064	methylated histone residue binding
GO:0016702	oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen
GO:0005515	protein binding
GO:0031625	ubiquitin protein ligase binding
GO:0008270	zinc ion binding

lysine (K)-specific demethylase 4A

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function