sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3E

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同義遺伝子名

SEMAH, M-SEMAH, M-sema H, SEMA3E, M-SemaK, Semaphorin-3E precursor, coll-5, KIAA0331

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:32 小脳:12.60 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:61.30 脊柱:- 網膜:- 目:23.50 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:12.90 骨髄:- 脂肪:40.30 骨:38.40 皮膚:9.60
GeneChip 大脳:3.30 小脳:2.93 脳幹:3.44 脳梁:2.91 松果体:- 末梢神経:3.04 脊柱:3.02 網膜:- 目:- 動脈:3.05 静脈:2.92 リンパ節:2.64 末梢血:- 脾臓:2.60 胸腺:3.08 骨髄:2.73 脂肪:2.64 骨:- 皮膚:3.02
CAGE 大脳:2.50 小脳:- 脳幹:2.31 脳梁:1.88 松果体:1.25 末梢神経:- 脊柱:2.87 網膜:- 目:- 動脈:2.28 静脈:1.29 リンパ節:0.83 末梢血:- 脾臓:0 胸腺:1.44 骨髄:- 脂肪:2.15 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.47 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.21 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.99 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:18.20 胎盤:- 前立腺:11.30 卵巣:74.50 精巣:17.30 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:10.60        肺:9.80    膀胱:- 腎臓:10.40 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:55.80 唾液腺:-
GeneChip 子宮:2.91 胎盤:2.55 前立腺:3.38 卵巣:2.82 精巣:2.58 心臓:2.70 骨格筋:2.88 食道:2.70 胃:2.74 腸:2.79 結腸:2.72 肝臓:2.56 肺:2.97 膀胱:- 腎臓:2.63 下垂体:2.70 甲状腺:2.65 副腎:2.66 膵臓:2.81 乳腺:3.14 唾液腺:2.71
CAGE 子宮:2.02 胎盤:0.81 前立腺:3.56 卵巣:0.92 精巣:0.70 心臓:0.54 骨格筋:0.30 食道:2.54 胃:- 腸:1.89 結腸:2.14     肝臓:0.63    肺:2.39 膀胱:2.84 腎臓:0.88 下垂体:1.48 甲状腺:1.05 副腎:- 膵臓:3.06 乳腺:2.02 唾液腺:2.17
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:1.39 卵巣:0.00 精巣:0.24 心臓:0.21 骨格筋:0.00 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.74     肝臓:0.00        肺:0.62    膀胱:- 腎臓:0.10 下垂体:- 甲状腺:0.33 副腎:0.28 膵臓:- 乳腺:0.48 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_012431
Gene ID 9723
Unigene ID Hs.528721
Probe set ID 206941_x_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000170381
GTEx ID ENSG00000170381

オーソログ対応遺伝子

マウス[3]  NM_011348
ラット[1]  NM_001106579

染色体

7q21.11  [82,993,222  -  83,278,479]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003659  Plexin/semaphorin/integrin
IPR001627  Semaphorin/CD100 antigen
IPR015943  WD40/YVTN repeat-like-containing domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9205841
9515811
12477932
12690205
12853948
15235037
15386596
15550623
16344560
17318185
18818766
18974298
20029409
20301296
20379614
20664171
20949546
21505259
21555518
21559368
21795701
22247010
23906303
23932461
24139859

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007411  axon guidance
GO:0016525  negative regulation of angiogenesis
GO:0001953  negative regulation of cell-matrix adhesion
GO:0001569  patterning of blood vessels
GO:0008360  regulation of cell shape
GO:0002040  sprouting angiogenesis
GO:0050808  synapse organization

Cellular Component

GO:0005576  extracellular region
GO:0005615  extracellular space
GO:0016020  membrane

Molecular Function

GO:0004872  receptor activity