histone deacetylase 9

同義遺伝子名

HDAC9, DKFZp779K1053, HD9, HDAC, HD7B, histone deacetylase 9, HDAC9FL, HD7, HDRP, HDAC9B, MITR, KIAA0744, HDAC7B, HDAC7, Histone deacetylase 9

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:35.60

小脳:25.20

脳幹:-

脳梁:-

松果体:148.30

末梢神経:61.30

脊柱:-

網膜:118.60

目:76.40

動脈:-

静脈:-

リンパ節:202.20

末梢血:18.20

脾臓:56.70

胸腺:12.90

骨髄:118.10

脂肪:-

骨:38.40

皮膚:91.20

GeneChip

大脳:6.03

小脳:5.73

脳幹:5.84

脳梁:5.93

松果体:-

末梢神経:5.75

脊柱:6.08

網膜:-

目:-

動脈:5.99

静脈:6.17

リンパ節:6.33

末梢血:-

脾臓:7.12

胸腺:5.27

骨髄:5.54

脂肪:5.63

骨:-

皮膚:5.15

CAGE

大脳:3.46

小脳:-

脳幹:3.49

脳梁:3.40

松果体:4.47

末梢神経:-

脊柱:3.70

網膜:-

目:-

動脈:4.00

静脈:2.95

リンパ節:3.29

末梢血:-

脾臓:3.67

胸腺:2.15

骨髄:-

脂肪:3.36

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.58

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:1.39

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.03

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:18.20

胎盤:14.60

前立腺:22.50

卵巣:37.30

精巣:17.30

心臓:12.80

骨格筋:-

食道:-

胃:21.20

腸:64.80

結腸:8.50

肝臓:10.60

肺:24.40

膀胱:-

腎臓:31.20

下垂体:116

甲状腺:-

副腎:50.80

膵臓:17.80

乳腺:65.10

唾液腺:-

GeneChip

子宮:6.08

胎盤:5.26

前立腺:6.13

卵巣:5.32

精巣:5.12

心臓:5.60

骨格筋:6.19

食道:4.80

胃:5.84

腸:5.42

結腸:5.10

肝臓:5.06

肺:5.31

膀胱:-

腎臓:4.81

下垂体:6.54

甲状腺:4.95

副腎:5.19

膵臓:5.52

乳腺:5.15

唾液腺:5.38

CAGE

子宮:3.65

胎盤:2.06

前立腺:2.93

卵巣:2.26

精巣:3.21

心臓:2.76

骨格筋:2.24

食道:2.71

胃:-

腸:1.79

結腸:2.27

肝臓:1.16

肺:2.57

膀胱:2.43

腎臓:1.82

下垂体:3.67

甲状腺:1.64

副腎:-

膵臓:0

乳腺:2.64

唾液腺:2.78

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:1.15

卵巣:0.20

精巣:0.23

心臓:0.00

骨格筋:0.32

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:1.41

肝臓:0.00

肺:0

膀胱:-

腎臓:0.00

下垂体:-

甲状腺:0.16

副腎:0.72

膵臓:-

乳腺:0.05

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_014707
Gene ID	9734
Unigene ID	Hs.196054
Probe set ID	205659_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000048052
GTEx ID	ENSG00000048052

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_024124
ラット [0]

染色体

7p21.1 [18,126,572 - 19,036,993]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR017320	Histone deacetylase class II, eukaryotic
IPR000286	Histone deacetylase superfamily

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0042113	B cell activation
GO:0030183	B cell differentiation
GO:0032869	cellular response to insulin stimulus
GO:0007507	heart development
GO:0016575	histone deacetylation
GO:0070932	histone H3 deacetylation
GO:0070933	histone H4 deacetylation
GO:0006954	inflammatory response
GO:0000122	negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0045892	negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0007219	Notch signaling pathway
GO:0034983	peptidyl-lysine deacetylation
GO:0090050	positive regulation of cell migration involved in sprouting angiogenesis
GO:0048742	regulation of skeletal muscle fiber development
GO:0051153	regulation of striated muscle cell differentiation
GO:0006351	transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0000118	histone deacetylase complex
GO:0035097	histone methyltransferase complex
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus
GO:0005667	transcription factor complex

Molecular Function

GO:0004407	histone deacetylase activity
GO:0042826	histone deacetylase binding
GO:0046872	metal ion binding
GO:0032041	NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K14 specific)
GO:0046969	NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K9 specific)
GO:0046970	NAD-dependent histone deacetylase activity (H4-K16 specific)
GO:0005515	protein binding
GO:0033558	protein deacetylase activity
GO:0005080	protein kinase C binding
GO:0003714	transcription corepressor activity
GO:0008134	transcription factor binding
GO:0070491	transcription repressor binding

histone deacetylase 9

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function