SET domain containing 1A

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同義遺伝子名

SET1, SET domain containing 1A, SET-domain-containing protein 1A, KIAA0339, Set1, SETD1A

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:7.10 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:61.30 脊柱:- 網膜:- 目:47 動脈:- 静脈:- リンパ節:40.40 末梢血:18.20 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:19.70 脂肪:- 骨:12.80 皮膚:9.60
GeneChip 大脳:6.25 小脳:6.59 脳幹:6.24 脳梁:6.31 松果体:- 末梢神経:5.86 脊柱:5.81 網膜:- 目:- 動脈:6.06 静脈:6.28 リンパ節:6.38 末梢血:- 脾臓:6.19 胸腺:6.24 骨髄:6.28 脂肪:6.17 骨:- 皮膚:5.93
CAGE 大脳:2.37 小脳:- 脳幹:2.35 脳梁:2.74 松果体:2.09 末梢神経:- 脊柱:2.06 網膜:- 目:- 動脈:2.50 静脈:2.49 リンパ節:2.65 末梢血:- 脾臓:2.77 胸腺:2.66 骨髄:- 脂肪:2.31 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.37 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.33 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.14 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:9.10 胎盤:18.20 前立腺:11.30 卵巣:- 精巣:26 心臓:12.80 骨格筋:20.10 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:59.40     肝臓:31.70        肺:14.70    膀胱:- 腎臓:10.40 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:8.90 乳腺:139.40 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.22 胎盤:6.37 前立腺:5.73 卵巣:6.30 精巣:6.28 心臓:6.31 骨格筋:6.40 食道:6.21 胃:6.34 腸:6.23 結腸:6.48 肝臓:6.43 肺:6.22 膀胱:- 腎臓:6.35 下垂体:6.23 甲状腺:6.14 副腎:6.32 膵臓:6.31 乳腺:6.23 唾液腺:6.18
CAGE 子宮:2.71 胎盤:2.48 前立腺:2.46 卵巣:2.76 精巣:3.12 心臓:2.04 骨格筋:2.31 食道:2.04 胃:- 腸:2.49 結腸:2.61     肝臓:2.30    肺:2.07 膀胱:2.24 腎臓:2.21 下垂体:2.58 甲状腺:2.27 副腎:- 膵臓:2.66 乳腺:2.41 唾液腺:2.57
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.18 卵巣:2.67 精巣:3.55 心臓:1.25 骨格筋:2.38 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.71     肝臓:1.18        肺:1.43    膀胱:- 腎臓:1.67 下垂体:- 甲状腺:2.75 副腎:2.89 膵臓:- 乳腺:1.74 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_014712
Gene ID 9739
Unigene ID Hs.297483
Probe set ID 213202_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000099381
GTEx ID ENSG00000099381

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_178029
ラット[1]  NM_178029

染色体

16p11.2  [30,968,615  -  30,995,985]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000504  RNA recognition motif, RNP-1

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9205841
12477932
12670868
15489334
16061203
16253997
17081983
17355966
17500065
17578910
17846119
17998332
18029348
18082152
18680430
18765639
18838538
19433449
19454010
19951360
20305087
20516061
20819778
21139048
21252943
21653943
21988832
22147691
22266653
22665483
22902626
22939629
23306522
23754954
24247718
24853937

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0051568  histone H3-K4 methylation
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005694  chromosome
GO:0035097  histone methyltransferase complex
GO:0016607  nuclear speck
GO:0005730  nucleolus
GO:0005634  nucleus
GO:0048188  Set1C/COMPASS complex

Molecular Function

GO:0042800  histone methyltransferase activity (H3-K4 specific)
GO:0000166  nucleotide binding
GO:0005515  protein binding
GO:0003723  RNA binding