chromobox homolog 5 (Drosophila HP1a)

同義遺伝子名

2610029O15Rik, HP1a, C75991, Cbx5, HP1 alpha, Hp1a, Chromobox protein homolog 5, Heterochromatin protein 1 homolog alpha, HP1, heterochromatin protein 1 alpha, chromobox homolog 5 (Drosophila HP1a)

正常組織・臓器 40分類
正常組織 (発生期含む)・初代培養細胞（FANTOM5 CAGE）

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:373.40

小脳:110.50

脳幹:190.70

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:114.70

脊柱:-

網膜:385.70

目:326.70

動脈:84.40

静脈:-

リンパ節:129.60

末梢血:71.90

脾臓:118.50

胸腺:197.60

骨髄:-

脂肪:-

骨:150.30

皮膚:102.90

GeneChip

大脳:7.38

小脳:7.01

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:6.73

脊柱:7.34

網膜:7.10

目:7.48

動脈:-

静脈:7.73

リンパ節:6.18

末梢血:-

脾臓:6.63

胸腺:-

骨髄:7.56

脂肪:7.08

骨:7.43

皮膚:6.33

CAGE

大脳:4.43

小脳:-

脳幹:4.55

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:4.52

網膜:-

目:-

動脈:4.01

静脈:-

リンパ節:3.97

末梢血:-

脾臓:4.39

胸腺:4.24

骨髄:-

脂肪:-

骨:4.71

皮膚:3.84

RNA-seq

大脳:3.59

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:174.50

胎盤:13.80

前立腺:154.40

卵巣:46

精巣:147.80

心臓:55.80

骨格筋:71

食道:-

胃:196.40

腸:147.90

結腸:35.20

肝臓:81.50

肺:80.30

膀胱:66.20

腎臓:32.20

下垂体:219.60

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:178.30

乳腺:104.50

唾液腺:-

GeneChip

子宮:6.99

胎盤:6.49

前立腺:6.06

卵巣:7.06

精巣:7.52

心臓:6.80

骨格筋:6.50

食道:-

胃:7.04

腸:6.94

結腸:-

肝臓:7.22

肺:6.73

膀胱:6.49

腎臓:7.61

下垂体:7.95

甲状腺:-

副腎:6.71

膵臓:7.63

乳腺:6.67

唾液腺:6.32

CAGE

子宮:3.87

胎盤:3.61

前立腺:3.02

卵巣:4.05

精巣:4.31

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:2.95

腸:3.55

結腸:3.41

肝臓:3.11

肺:4.02

膀胱:3.55

腎臓:-

下垂体:4.51

甲状腺:-

副腎:3.67

膵臓:3.71

乳腺:3.60

唾液腺:-

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:2.37

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:2.13

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001076789
Gene ID	12419
Unigene ID	Mm.262059
Probe set ID	1421934_at [Mouse430_2]
Ensembl ID	ENSMUSG00000009575

オーソログ対応遺伝子

ヒト[6]	NM_001127321, NM_001127322, NM_012117
ラット[1]	NM_001106797, NM_001127322, NM_012117

染色体

15F3 [103,021,975 - 103,070,247]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000953	Chromo domain
IPR017984	Chromo domain subgroup
IPR016197	Chromo domain-like
IPR008251	Chromo shadow
IPR018125	Chromo shadow, subgroup

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0045892

negative regulation of transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0010369	chromocenter
GO:0005694	chromosome
GO:0000775	chromosome, centromeric region
GO:0005737	cytoplasm
GO:0000792	heterochromatin
GO:0000118	histone deacetylase complex
GO:0035097	histone methyltransferase complex
GO:0000776	kinetochore
GO:0005720	nuclear heterochromatin
GO:0005730	nucleolus
GO:0005634	nucleus
GO:0016605	PML body
GO:0017053	transcriptional repressor complex

Molecular Function

GO:0003682	chromatin binding
GO:0019899	enzyme binding
GO:0042826	histone deacetylase binding
GO:0035064	methylated histone residue binding
GO:0005515	protein binding
GO:0030674	protein binding, bridging
GO:0042803	protein homodimerization activity
GO:0070491	transcription repressor binding

chromobox homolog 5 (Drosophila HP1a)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function