chromodomain helicase DNA binding protein 1

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

ATP-dependent helicase CHD1, AI851787, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, AW555109, chromodomain helicase DNA binding protein 1, Chd-1, CHD-1, MGC141554, 4930525N21Rik, Chd1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:72.90 小脳:55.30 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:38.20 脊柱:94.60 網膜:32.10 目:83.60 動脈:- 静脈:- リンパ節:10.80 末梢血:129.40 脾臓:- 胸腺:237.10 骨髄:12.80 脂肪:212.70 骨:25 皮膚:15.80
GeneChip 大脳:4.35 小脳:4.40 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:4.49 脊柱:4.14 網膜:5.06 目:5.01 動脈:- 静脈:4.88 リンパ節:4.92 末梢血:- 脾臓:4.97 胸腺:- 骨髄:5.13 脂肪:4.53 骨:4.99 皮膚:4.78
CAGE 大脳:3.28 小脳:- 脳幹:2.85 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:2.94 網膜:- 目:- 動脈:3.42 静脈:- リンパ節:4.01 末梢血:- 脾臓:3.82 胸腺:4.69 骨髄:- 脂肪:- 骨:3.54 皮膚:4.02
RNA-seq 大脳:3.71 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:13.80 前立腺:- 卵巣:23 精巣:44.30 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:327.30 腸:37 結腸:17.60     肝臓:27.20        肺:30.10    膀胱:- 腎臓:24.20 下垂体:12.90 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:46.90 乳腺:52.20 唾液腺:-
GeneChip 子宮:4.93 胎盤:5.21 前立腺:4.63 卵巣:4.57 精巣:4.43 心臓:4.49 骨格筋:4.47 食道:- 胃:4.76 腸:4.91 結腸:- 肝臓:4.88 肺:4.67 膀胱:4.72 腎臓:4.60 下垂体:4.47 甲状腺:- 副腎:4.64 膵臓:4.43 乳腺:4.78 唾液腺:4.72
CAGE 子宮:3.44 胎盤:3.56 前立腺:3.45 卵巣:3.34 精巣:3.48 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:2.85 腸:3.87 結腸:3.65     肝臓:3.46    肺:3.62 膀胱:3.30 腎臓:- 下垂体:3.02 甲状腺:- 副腎:3.14 膵臓:3.32 乳腺:3.42 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:1.45 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:2.57        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_007690
Gene ID 12648
Unigene ID Mm.8137
Probe set ID 1450077_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000023852

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]  NM_001270
ラット[1]  NM_001107465

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000953  Chromo domain
IPR014001  DEAD-like helicase, N-terminal
IPR014021  Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8460153
8889548
9326634
10199952
10349636
10655032
10922068
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
12520002
14610273
16141072
16141073
16415155
17967808
18799693
19587682
19841136
19855082
20362542
21677750
21979373

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006333  chromatin assembly or disassembly
GO:0016568  chromatin modification
GO:0006338  chromatin remodeling
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0005524  ATP binding
GO:0003682  chromatin binding
GO:0003677  DNA binding
GO:0004386  helicase activity
GO:0016787  hydrolase activity
GO:0035064  methylated histone residue binding
GO:0003676  nucleic acid binding
GO:0000166  nucleotide binding