collagen, type XI, alpha 1

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同義遺伝子名

Col11a1, procollagen, type XI, alpha 1, cho, Collagen alpha-1(XI) chain precursor

正常組織・臓器 40分類
正常組織 (発生期含む)・初代培養細胞（FANTOM5 CAGE）

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:81.60

小脳:-

脳幹:158.90

脳梁:-

松果体:515.60

末梢神経:344

脊柱:189.10

網膜:-

目:53.20

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:112.70

皮膚:63.30

GeneChip

大脳:5.72

小脳:4.20

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:7.33

脊柱:7.50

網膜:4.96

目:5.76

動脈:-

静脈:8.89

リンパ節:4.03

末梢血:-

脾臓:4.03

胸腺:-

骨髄:4.93

脂肪:4.67

骨:11.12

皮膚:4.91

CAGE

大脳:1.21

小脳:-

脳幹:2.59

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:2.92

網膜:-

目:-

動脈:0.25

静脈:-

リンパ節:0

末梢血:-

脾臓:0

胸腺:0

骨髄:-

脂肪:-

骨:3.71

皮膚:2.15

RNA-seq

大脳:1.07

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:43.60

胎盤:27.60

前立腺:-

卵巣:23

精巣:29.60

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:-

肺:40.20

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:12.90

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:107.70

唾液腺:-

GeneChip

子宮:5.17

胎盤:4.12

前立腺:4.48

卵巣:7.45

精巣:4.32

心臓:4.11

骨格筋:5.83

食道:-

胃:4.21

腸:4.44

結腸:-

肝臓:4.34

肺:4.12

膀胱:6.38

腎臓:4.07

下垂体:6.88

甲状腺:-

副腎:4.87

膵臓:4.78

乳腺:5.86

唾液腺:7.82

CAGE

子宮:1.65

胎盤:1.55

前立腺:0.51

卵巣:3.15

精巣:0.75

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:0

腸:0

結腸:0

肝臓:0

肺:0.17

膀胱:2.10

腎臓:-

下垂体:2.32

甲状腺:-

副腎:1.26

膵臓:0

乳腺:1.83

唾液腺:-

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:1.32

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:0

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_007729
Gene ID	12814
Unigene ID	Mm.209715
Probe set ID	1418599_at [Mouse430_2]
Ensembl ID	ENSMUSG00000027966

オーソログ対応遺伝子

ヒト[5]	NM_001190709, NM_001854, NM_080629, NM_080630
ラット[5]	NM_001190709, NM_001854, NM_080629, NM_080630

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR008985	Concanavalin A-like lectin/glucanase
IPR013320	Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup
IPR001791	Laminin G

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0001502	cartilage condensation
GO:0051216	cartilage development
GO:0002063	chondrocyte development
GO:0030199	collagen fibril organization
GO:0050910	detection of mechanical stimulus involved in sensory perception of sound
GO:0048704	embryonic skeletal system morphogenesis
GO:0003007	heart morphogenesis
GO:0042472	inner ear morphogenesis
GO:0006029	proteoglycan metabolic process
GO:0007605	sensory perception of sound
GO:0048705	skeletal system morphogenesis
GO:0055010	ventricular cardiac muscle tissue morphogenesis
GO:0007601	visual perception

Cellular Component

GO:0005581	collagen
GO:0005592	collagen type XI
GO:0031012	extracellular matrix
GO:0005576	extracellular region
GO:0005578	proteinaceous extracellular matrix

Molecular Function

GO:0005201	extracellular matrix structural constituent
GO:0046872	metal ion binding
GO:0003674	molecular_function

collagen, type XI, alpha 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function