excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 3

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同義遺伝子名

DNA-repair protein complementing XP-B cells, BTF2-p89, Ercc-3, Basic transcription factor 2 89 kDa subunit, Xpbc, XPB, Ercc3, Xpb, DNA excision repair protein ERCC-3, TFIIH 89 kDa subunit

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:53.80 小脳:36.80 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:76.40 脊柱:94.60 網膜:64.30 目:76 動脈:- 静脈:- リンパ節:496.90 末梢血:57.50 脾臓:65.80 胸腺:39.50 骨髄:102.60 脂肪:- 骨:175.30 皮膚:87.10
GeneChip 大脳:7.46 小脳:7.52 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:8.49 脊柱:7.54 網膜:7.93 目:7.94 動脈:- 静脈:7.62 リンパ節:8.25 末梢血:- 脾臓:8.13 胸腺:- 骨髄:8.14 脂肪:8.33 骨:7.99 皮膚:7.74
CAGE 大脳:2.94 小脳:- 脳幹:2.71 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:2.79 網膜:- 目:- 動脈:2.09 静脈:- リンパ節:3.12 末梢血:- 脾臓:2.52 胸腺:2.86 骨髄:- 脂肪:- 骨:2.19 皮膚:2.34
RNA-seq 大脳:5.28 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:43.60 胎盤:41.40 前立腺:30.90 卵巣:23 精巣:59.10 心臓:37.20 骨格筋:35.50 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:17.60     肝臓:18.10        肺:40.20    膀胱:66.20 腎臓:56.40 下垂体:51.70 甲状腺:112.50 副腎:- 膵臓:28.10 乳腺:39.20 唾液腺:-
GeneChip 子宮:8.28 胎盤:8 前立腺:8.46 卵巣:8.18 精巣:9.10 心臓:7.27 骨格筋:7.38 食道:- 胃:8.03 腸:8.34 結腸:- 肝臓:7.88 肺:7.99 膀胱:8.10 腎臓:7.97 下垂体:7.84 甲状腺:- 副腎:8.47 膵臓:7.16 乳腺:7.85 唾液腺:7.83
CAGE 子宮:2.84 胎盤:2.68 前立腺:2.95 卵巣:2.39 精巣:3.98 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:2.95 腸:2.87 結腸:2.99     肝臓:2.95    肺:2.76 膀胱:2.94 腎臓:- 下垂体:2.75 甲状腺:- 副腎:2.72 膵臓:2.03 乳腺:2.96 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:6.47 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:3.59        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_133658
Gene ID 13872
Unigene ID Mm.282335
Probe set ID 1448497_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000024382

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]  NM_000122
ラット[1]  NM_001031644

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR014001  DEAD-like helicase, N-terminal
IPR014021  Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1747940
7805288
10349636
10777215
10922068
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
14980221
15489334
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16141072
16141073
17276355
19114557
19841728
20059953
20498273
22863773
22922362
23562818
24127601
24457600

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006200  ATP catabolic process
GO:0000075  cell cycle checkpoint
GO:0006281  DNA repair
GO:0006265  DNA topological change
GO:0035315  hair cell differentiation
GO:0006917  induction of apoptosis
GO:0006289  nucleotide-excision repair
GO:0000717  nucleotide-excision repair, DNA duplex unwinding
GO:0033683  nucleotide-excision repair, DNA incision
GO:0045944  positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006468  protein amino acid phosphorylation
GO:0008104  protein localization
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006974  response to DNA damage stimulus
GO:0006979  response to oxidative stress
GO:0009411  response to UV
GO:0006366  transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006351  transcription, DNA-dependent
GO:0006283  transcription-coupled nucleotide-excision repair
GO:0009650  UV protection

Cellular Component

GO:0005675  holo TFIIH complex
GO:0005634  nucleus
GO:0000441  SSL2-core TFIIH complex

Molecular Function

GO:0043138  3'-5' DNA helicase activity
GO:0005524  ATP binding
GO:0004003  ATP-dependent DNA helicase activity
GO:0016887  ATPase activity
GO:0032564  dATP binding
GO:0003677  DNA binding
GO:0008094  DNA-dependent ATPase activity
GO:0005525  GTP binding
GO:0004386  helicase activity
GO:0016787  hydrolase activity
GO:0003676  nucleic acid binding
GO:0000166  nucleotide binding
GO:0042277  peptide binding
GO:0008022  protein C-terminus binding
GO:0004672  protein kinase activity
GO:0047485  protein N-terminus binding
GO:0008353  RNA polymerase II carboxy-terminal domain kinase activity