butyrobetaine (gamma), 2-oxoglutarate dioxygenase 1 (gamma-butyrobetaine hydroxylase)

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同義遺伝子名

Bbox1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, Gamma-BBH, Gamma-butyrobetaine hydroxylase, AI874739, Gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:6.15 小脳:6.94 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:5.47 脊柱:8.24 網膜:5.77 目:6.05 動脈:- 静脈:6.28 リンパ節:5.41 末梢血:- 脾臓:5.55 胸腺:- 骨髄:5.52 脂肪:6.79 骨:5.90 皮膚:11.31
CAGE 大脳:1.58 小脳:- 脳幹:2.70 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:3.18 網膜:- 目:- 動脈:0.54 静脈:- リンパ節:0 末梢血:- 脾臓:0 胸腺:0.27 骨髄:- 脂肪:- 骨:0 皮膚:4.07
RNA-seq 大脳:2.00 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:5.47 胎盤:5.59 前立腺:5.66 卵巣:6.83 精巣:6.21 心臓:5.97 骨格筋:5.68 食道:- 胃:5.58 腸:6.02 結腸:- 肝臓:11.96 肺:6.63 膀胱:6.31 腎臓:5.84 下垂体:5.87 甲状腺:- 副腎:5.64 膵臓:5.79 乳腺:6.95 唾液腺:5.73
CAGE 子宮:0 胎盤:0 前立腺:0.37 卵巣:1.38 精巣:1.97 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:0.67 腸:4.03 結腸:2.62     肝臓:5.85    肺:1.28 膀胱:1.89 腎臓:- 下垂体:0 甲状腺:- 副腎:0.64 膵臓:0 乳腺:3.14 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:25.52        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_130452
Gene ID 170442
Unigene ID -
Probe set ID 1419618_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000041660

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]  NM_003986
ラット[1]  NM_022629

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR012775  Gamma-butyrobetaine,2-oxoglutarate dioxygenase
IPR003819  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
10349636
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
14681479
15489334
16141072
16141073
18614015
19474196
21267068
21549104
21677750

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0045329  carnitine biosynthetic process
GO:0055114  oxidation reduction

Cellular Component

GO:0015629  actin cytoskeleton
GO:0005737  cytoplasm
GO:0043231  intracellular membrane-bounded organelle
GO:0005739  mitochondrion

Molecular Function

GO:0008336  gamma-butyrobetaine dioxygenase activity
GO:0005506  iron ion binding
GO:0046872  metal ion binding
GO:0016491  oxidoreductase activity
GO:0016706  oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, 2-oxoglutarate as one donor, and incorporation of one atom each of oxygen into both donors
GO:0016702  oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen
GO:0008270  zinc ion binding