procollagen-proline, 2-oxoglutarate 4-dioxygenase (proline 4-hydroxylase), alpha 1 polypeptide

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同義遺伝子名

4-PH alpha-1, P4ha, Prolyl 4-hydroxylase alpha-1 subunit precursor, P4ha1, AL022634

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:6.80 小脳:6.30 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:7.23 脊柱:6.54 網膜:4.68 目:5.11 動脈:- 静脈:8.77 リンパ節:6.79 末梢血:- 脾臓:6.65 胸腺:- 骨髄:5.88 脂肪:6.61 骨:5.87 皮膚:5.48
CAGE 大脳:3.88 小脳:- 脳幹:3.77 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:3.87 網膜:- 目:- 動脈:4.01 静脈:- リンパ節:4.15 末梢血:- 脾臓:3.42 胸腺:3.41 骨髄:- 脂肪:- 骨:3.41 皮膚:3.87
RNA-seq 大脳:6.80 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:6.83 胎盤:9.69 前立腺:5.76 卵巣:7.25 精巣:5.54 心臓:7.25 骨格筋:8.11 食道:- 胃:6.64 腸:6.18 結腸:- 肝臓:6.29 肺:8.53 膀胱:7.59 腎臓:7.75 下垂体:8.63 甲状腺:- 副腎:5.66 膵臓:5.67 乳腺:6.42 唾液腺:5.73
CAGE 子宮:4.19 胎盤:4.97 前立腺:4.02 卵巣:4.32 精巣:2.71 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:2.90 腸:2.87 結腸:2.62     肝臓:3.90    肺:4.49 膀胱:4.07 腎臓:- 下垂体:4.85 甲状腺:- 副腎:3.94 膵臓:3.53 乳腺:2.95 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:5.54 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:2.36        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_011030
Gene ID 18451
Unigene ID -
Probe set ID 1426519_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000019916

オーソログ対応遺伝子

ヒト[8]  NM_000917, NM_001017962, NM_001142595, NM_001142596
ラット[8]  NM_000917, NM_001017962, NM_001142595, NM_001142596

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR005123  Oxoglutarate/iron-dependent oxygenase
IPR006620  Prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit
IPR019734  Tetratricopeptide repeat

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1694844
7671812
7753822
8889548
10349636
10922068
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
12904583
12958152
14610273
14681479
15489334
15536133
15782199
16141072
16141073
16602821
17135260
18287559
18799693
20362542
21267068
21677750
22083510
22930750
23022409
24457600

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0030199  collagen fibril organization
GO:0055114  oxidation reduction
GO:0018401  peptidyl-proline hydroxylation to 4-hydroxy-L-proline

Cellular Component

GO:0005783  endoplasmic reticulum
GO:0043231  intracellular membrane-bounded organelle
GO:0005739  mitochondrion

Molecular Function

GO:0005506  iron ion binding
GO:0031418  L-ascorbic acid binding
GO:0046872  metal ion binding
GO:0016491  oxidoreductase activity
GO:0016705  oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen
GO:0016706  oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, 2-oxoglutarate as one donor, and incorporation of one atom each of oxygen into both donors
GO:0016702  oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen
GO:0004656  procollagen-proline 4-dioxygenase activity