vacuolar protein sorting 4b (yeast)

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同義遺伝子名

Protein SKD1, Skd1, Vacuolar protein sorting-associating protein 4B, Vps4b, 8030489C12Rik, vacuolar protein sorting 4b (yeast)

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:9.44 小脳:9.05 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:10.91 脊柱:9.27 網膜:10.57 目:11.12 動脈:- 静脈:10.99 リンパ節:10.90 末梢血:- 脾臓:10.56 胸腺:- 骨髄:10.59 脂肪:10.24 骨:11.10 皮膚:11.36
CAGE 大脳:2.76 小脳:- 脳幹:2.90 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:3.03 網膜:- 目:- 動脈:3.08 静脈:- リンパ節:3.49 末梢血:- 脾臓:2.93 胸腺:3.17 骨髄:- 脂肪:- 骨:3.18 皮膚:3.56
RNA-seq 大脳:3.33 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:10.54 胎盤:11.25 前立腺:10.61 卵巣:10.71 精巣:8.51 心臓:9.45 骨格筋:9.06 食道:- 胃:10.80 腸:11.11 結腸:- 肝臓:10.14 肺:10.18 膀胱:10.73 腎臓:10.10 下垂体:10.21 甲状腺:- 副腎:10.82 膵臓:9.63 乳腺:10.49 唾液腺:11.01
CAGE 子宮:3.28 胎盤:3.72 前立腺:3.30 卵巣:3.25 精巣:3.43 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:3.00 腸:3.62 結腸:3.65     肝臓:3.04    肺:3.19 膀胱:3.38 腎臓:- 下垂体:3.16 甲状腺:- 副腎:3.24 膵臓:3.21 乳腺:3.41 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:2.31 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:5.57        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_009190
Gene ID 20479
Unigene ID -
Probe set ID 1417007_a_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000009907

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]  NM_004869
ラット [0]  

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003593  ATPase, AAA+ type, core

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8082782
10349636
10393249
10637304
10679028
10922068
11042159
11076861
11217851
11563910
12466851
12477932
12520002
12594041
15173323
15489334
16141072
16141073
16757520
18796009
21267068

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006200  ATP catabolic process
GO:0007049  cell cycle
GO:0051301  cell division
GO:0030301  cholesterol transport
GO:0007032  endosome organization
GO:0032510  endosome to lysosome transport via multivesicular body sorting pathway
GO:0016197  endosome transport
GO:0032367  intracellular cholesterol transport
GO:0006813  potassium ion transport
GO:0015031  protein transport
GO:0033993  response to lipid
GO:0006810  transport

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0005829  cytosol
GO:0005769  early endosome
GO:0005768  endosome
GO:0010008  endosome membrane
GO:0005770  late endosome
GO:0005764  lysosome
GO:0016020  membrane
GO:0005634  nucleus
GO:0005774  vacuolar membrane

Molecular Function

GO:0005524  ATP binding
GO:0016887  ATPase activity
GO:0016787  hydrolase activity
GO:0017111  nucleoside-triphosphatase activity
GO:0000166  nucleotide binding
GO:0005515  protein binding
GO:0008022  protein C-terminus binding