lysine (K)-specific demethylase 5C

同義遺伝子名

jumonji, AT rich interactive domain 1C (Rbp2 like), Smcx, Xe169 protein, Xe169, mKIAA0234, SmcX protein, Jarid1c, Jumonji/ARID domain-containing protein 1C

正常組織・臓器 40分類
正常組織 (発生期含む)・初代培養細胞（FANTOM5 CAGE）

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:118.10

小脳:55.30

脳幹:127.10

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:172

脊柱:47.30

網膜:160.70

目:243.10

動脈:84.40

静脈:-

リンパ節:183.60

末梢血:28.80

脾臓:26.30

胸腺:49.40

骨髄:12.80

脂肪:-

骨:25

皮膚:23.80

GeneChip

大脳:4.87

小脳:4.99

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:4.55

脊柱:4.61

網膜:4.75

目:4.95

動脈:-

静脈:5.17

リンパ節:5.47

末梢血:-

脾臓:5.27

胸腺:-

骨髄:5.72

脂肪:4.97

骨:5.12

皮膚:4.97

CAGE

大脳:3.66

小脳:-

脳幹:3.49

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:3.27

網膜:-

目:-

動脈:3.91

静脈:-

リンパ節:4.21

末梢血:-

脾臓:4.07

胸腺:3.91

骨髄:-

脂肪:-

骨:3.92

皮膚:4.11

RNA-seq

大脳:3.05

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:130.90

胎盤:207.10

前立腺:-

卵巣:91.90

精巣:29.60

心臓:-

骨格筋:71

食道:-

胃:65.50

腸:110.90

結腸:-

肝臓:90.50

肺:40.20

膀胱:-

腎臓:8.10

下垂体:-

甲状腺:112.50

副腎:-

膵臓:65.70

乳腺:68.60

唾液腺:108

GeneChip

子宮:5.24

胎盤:5.76

前立腺:4.55

卵巣:5.25

精巣:4.53

心臓:5.18

骨格筋:5.19

食道:-

胃:4.98

腸:5.04

結腸:-

肝臓:5.37

肺:4.86

膀胱:4.77

腎臓:4.94

下垂体:5.09

甲状腺:-

副腎:5.01

膵臓:5.22

乳腺:5.50

唾液腺:4.95

CAGE

子宮:4.28

胎盤:4.33

前立腺:4.21

卵巣:4.17

精巣:2.36

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:3.36

腸:4.44

結腸:3.96

肝臓:3.97

肺:3.83

膀胱:3.74

腎臓:-

下垂体:3.83

甲状腺:-

副腎:3.76

膵臓:3.97

乳腺:4.24

唾液腺:-

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:2.78

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:3.83

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_013668
Gene ID	20591
Unigene ID	Mm.142655
Probe set ID	1426498_at [Mouse430_2]
Ensembl ID	ENSMUSG00000025332

オーソログ対応遺伝子

ヒト[2]	NM_001146702, NM_004187
ラット[2]	NM_001146702, NM_004187

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003347	Transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase
IPR019787	Zinc finger, PHD-finger
IPR001965	Zinc finger, PHD-type

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0016568	chromatin modification
GO:0034720	histone H3-K4 demethylation
GO:0000122	negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0055114	oxidation reduction
GO:0006355	regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351	transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0005622	intracellular
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0003677	DNA binding
GO:0032453	histone demethylase activity (H3-K4 specific)
GO:0042802	identical protein binding
GO:0046872	metal ion binding
GO:0016491	oxidoreductase activity
GO:0016706	oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, 2-oxoglutarate as one donor, and incorporation of one atom each of oxygen into both donors
GO:0016702	oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen
GO:0008270	zinc ion binding

lysine (K)-specific demethylase 5C

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function