lysine (K)-specific demethylase 5D

同義遺伝子名

Jarid1d, H-Y, Histocompatibility Y antigen, SmcY protein, Jumonji/ARID domain-containing protein 1D, Hya, jumonji, AT rich interactive domain 1D (Rbp2 like), Smcy

正常組織・臓器 40分類
正常組織 (発生期含む)・初代培養細胞（FANTOM5 CAGE）

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:31.30

小脳:73.70

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:30.40

動脈:84.40

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:92.20

胸腺:88.90

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

GeneChip

大脳:4.82

小脳:5.29

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:4.55

脊柱:4.57

網膜:4.46

目:4.52

動脈:-

静脈:4.47

リンパ節:5.88

末梢血:-

脾臓:5.50

胸腺:-

骨髄:5.12

脂肪:4.98

骨:4.62

皮膚:4.89

CAGE

nodata

RNA-seq

大脳:1.00

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:-

前立腺:30.90

卵巣:-

精巣:14.80

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:-

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:4.23

胎盤:4.65

前立腺:4.57

卵巣:4.18

精巣:4.15

心臓:4.70

骨格筋:5.12

食道:-

胃:4.86

腸:5.39

結腸:-

肝臓:4.83

肺:4.63

膀胱:5.02

腎臓:4.77

下垂体:4.97

甲状腺:-

副腎:5.07

膵臓:4.74

乳腺:4.02

唾液腺:4.49

CAGE

nodata

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:3.27

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:1.73

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_011419
Gene ID	20592
Unigene ID	Mm.262676
Probe set ID	1452563_a_at [Mouse430_2]
Ensembl ID	ENSMUSG00000056673

オーソログ対応遺伝子

ヒト[3]	NM_001146705, NM_001146706, NM_004653
ラット[3]	NM_001146705, NM_001146706, NM_004653

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003347	Transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase
IPR019787	Zinc finger, PHD-finger
IPR001965	Zinc finger, PHD-type

GO:0016568	chromatin modification
GO:0034720	histone H3-K4 demethylation
GO:0055114	oxidation reduction

GO:0005622	intracellular
GO:0005634	nucleus

GO:0003677	DNA binding
GO:0032453	histone demethylase activity (H3-K4 specific)
GO:0046872	metal ion binding
GO:0016491	oxidoreductase activity
GO:0016706	oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, 2-oxoglutarate as one donor, and incorporation of one atom each of oxygen into both donors
GO:0016702	oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen
GO:0008270	zinc ion binding

lysine (K)-specific demethylase 5D

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function