small nuclear ribonucleoprotein B

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同義遺伝子名

SMB, Sm protein B, SNRNP-B, small nuclear ribonucleoprotein B, SmB, snRNP-B, SM-B, Sm-B, SM11, Snrpb, AU018828

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:9.43 小脳:10.17 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:9.48 脊柱:9.33 網膜:8.89 目:8.99 動脈:- 静脈:9.99 リンパ節:10.76 末梢血:- 脾臓:10.84 胸腺:- 骨髄:10.73 脂肪:10.14 骨:10.41 皮膚:9.62
CAGE 大脳:3.71 小脳:- 脳幹:3.69 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:3.49 網膜:- 目:- 動脈:3.76 静脈:- リンパ節:3.63 末梢血:- 脾臓:4.56 胸腺:4.41 骨髄:- 脂肪:- 骨:4.83 皮膚:3.78
RNA-seq 大脳:35.95 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:10.60 胎盤:9.71 前立腺:10.08 卵巣:10.45 精巣:9.69 心臓:9.92 骨格筋:10.59 食道:- 胃:10.06 腸:10.19 結腸:- 肝臓:9.60 肺:10.43 膀胱:10.20 腎臓:10 下垂体:9.46 甲状腺:- 副腎:8.94 膵臓:8.33 乳腺:10.43 唾液腺:9.01
CAGE 子宮:4.14 胎盤:4.21 前立腺:3.86 卵巣:4.05 精巣:4.58 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:4.07 腸:4.21 結腸:3.90     肝臓:4.16    肺:4.18 膀胱:4.04 腎臓:- 下垂体:4.07 甲状腺:- 副腎:4.08 膵臓:3.94 乳腺:4.10 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:28.38 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:14.16        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_009225
Gene ID 20638
Unigene ID -
Probe set ID 1419260_a_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000027404

オーソログ対応遺伝子

ヒト[3]  NM_003091, NM_198216
ラット[1]  NM_134358, NM_198216

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001163  Like-Sm ribonucleoprotein (LSM) domain
IPR006649  Like-Sm ribonucleoprotein (LSM) domain, eukaryotic/archaea-type
IPR017131  Small ribonucleoprotein associated, SmB/SmN

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1376292
7671812
7680326
7744014
9724750
10349636
10556313
10725249
10922068
11042159
11076861
11217851
12466851
12520002
15369763
15782199
16141072
16141073
16236758
16602821
17218272
19470752
20059953
21677750

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006397  mRNA processing
GO:0008380  RNA splicing

Cellular Component

GO:0071013  catalytic step 2 spliceosome
GO:0005737  cytoplasm
GO:0071204  histone pre-mRNA 3'end processing complex
GO:0005634  nucleus
GO:0030529  ribonucleoprotein complex
GO:0005681  spliceosomal complex
GO:0005689  U12-type spliceosomal complex
GO:0005683  U7 snRNP

Molecular Function

GO:0071208  histone pre-mRNA DCP binding
GO:0005515  protein binding
GO:0003723  RNA binding