small nuclear ribonucleoprotein D1

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同義遺伝子名

small nuclear ribonucleoprotein D1, Sm-D autoantigen, Sm-D1, snRNP core protein D1, AA407109, Snrpd1, AL023031, SMD1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:- 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
GeneChip 大脳:8.73 小脳:8.51 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:8.78 脊柱:8.29 網膜:6.90 目:6.87 動脈:- 静脈:9.18 リンパ節:9.20 末梢血:- 脾臓:8.94 胸腺:- 骨髄:9.98 脂肪:8.26 骨:9.73 皮膚:8.22
CAGE nodata
RNA-seq 大脳:4.89 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:43.60 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:34.50 精巣:110.80 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:9.10        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:9.40 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:9.26 胎盤:8.67 前立腺:8.37 卵巣:9.31 精巣:8.90 心臓:7.49 骨格筋:7.79 食道:- 胃:8.43 腸:8.82 結腸:- 肝臓:7.86 肺:8.41 膀胱:8.50 腎臓:7.66 下垂体:8.83 甲状腺:- 副腎:8.84 膵臓:6.44 乳腺:8.52 唾液腺:8.03
CAGE nodata
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:4.15 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:4.61        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_009226
Gene ID 20641
Unigene ID Mm.60331
Probe set ID 1416336_s_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000002477

オーソログ対応遺伝子

ヒト[2]  NM_006938
ラット[1]  NM_001106163

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001163  Like-Sm ribonucleoprotein (LSM) domain
IPR006649  Like-Sm ribonucleoprotein (LSM) domain, eukaryotic/archaea-type

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1388635
7671812
10349636
10922068
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
12904583
14610273
15324931
15369763
15489334
15494537
16141072
16141073
18799693
23665500
24457600

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006397  mRNA processing
GO:0008380  RNA splicing

Cellular Component

GO:0071013  catalytic step 2 spliceosome
GO:0005737  cytoplasm
GO:0005634  nucleus
GO:0030529  ribonucleoprotein complex
GO:0005681  spliceosomal complex
GO:0005689  U12-type spliceosomal complex