leprecan-like 1

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同義遺伝子名

Leprel1, Prolyl 3-hydroxylase 2 precursor, AW553532, 4832416N06, P3h2, Leprecan-like protein 1, MLAT4, Mlat4, leprecan-like 1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:12.20 小脳:- 脳幹:63.60 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:45.60 動脈:- 静脈:- リンパ節:32.40 末梢血:14.40 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:75.10 皮膚:-
GeneChip nodata
CAGE 大脳:1.62 小脳:- 脳幹:1.70 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:2.17 網膜:- 目:- 動脈:3.13 静脈:- リンパ節:2.85 末梢血:- 脾臓:2.95 胸腺:1.26 骨髄:- 脂肪:- 骨:1.84 皮膚:3.71
RNA-seq 大脳:1.12 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:130.90 胎盤:13.80 前立腺:- 卵巣:23 精巣:- 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:20.10    膀胱:- 腎臓:80.60 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:13.10 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:2.82 胎盤:2.94 前立腺:1.60 卵巣:3.44 精巣:0.45 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:2.73 腸:1.14 結腸:1.63     肝臓:1.12    肺:2.71 膀胱:3.05 腎臓:- 下垂体:1.40 甲状腺:- 副腎:2.23 膵臓:1.84 乳腺:3.45 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:1.67 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:1.54        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_173379
Gene ID 210530
Unigene ID Mm.326869
Probe set ID -
Ensembl ID ENSMUSG00000038168

オーソログ対応遺伝子

ヒト[2]  NM_001134418, NM_018192
ラット[1]  NM_001025627, NM_018192

染色体

16B1  [25,959,374  -  26,105,870]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR005123  Oxoglutarate/iron-dependent oxygenase
IPR006620  Prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10349636
10922068
11042159
11076861
11217851
12466851
15063763
15782199
16141072
16141073
18487197
18798549
19652424
21267068
21677750
21757687
24368846

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0032963  collagen metabolic process
GO:0008285  negative regulation of cell proliferation
GO:0055114  oxidation reduction
GO:0019511  peptidyl-proline hydroxylation

Cellular Component

GO:0005604  basement membrane
GO:0005783  endoplasmic reticulum
GO:0005794  Golgi apparatus

Molecular Function

GO:0005506  iron ion binding
GO:0031418  L-ascorbic acid binding
GO:0046872  metal ion binding
GO:0016491  oxidoreductase activity
GO:0016705  oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen
GO:0016706  oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, 2-oxoglutarate as one donor, and incorporation of one atom each of oxygen into both donors
GO:0016702  oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen
GO:0019797  procollagen-proline 3-dioxygenase activity