transcription elongation factor A (SII) 1

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同義遺伝子名

Tcea1, S-II, MGC103154, Transcription elongation factor TFIIS.o, transcription elongation factor A (SII) 1, Tceat, Transcription elongation factor S-II protein 1, Transcription elongation factor A protein 1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:72.90 小脳:- 脳幹:31.80 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:114.70 脊柱:- 網膜:64.30 目:106.40 動脈:84.40 静脈:- リンパ節:54 末梢血:57.50 脾臓:52.70 胸腺:69.20 骨髄:89.80 脂肪:212.70 骨:37.60 皮膚:71.30
GeneChip 大脳:10.03 小脳:9.97 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:9.69 脊柱:9.38 網膜:9.54 目:9.65 動脈:- 静脈:10.03 リンパ節:10.87 末梢血:- 脾臓:10.39 胸腺:- 骨髄:11.13 脂肪:10.09 骨:10.74 皮膚:10.10
CAGE 大脳:3.59 小脳:- 脳幹:3.49 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:3.35 網膜:- 目:- 動脈:3.49 静脈:- リンパ節:3.80 末梢血:- 脾臓:3.66 胸腺:3.23 骨髄:- 脂肪:- 骨:3.52 皮膚:3.91
RNA-seq 大脳:9.25 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:87.20 胎盤:69 前立腺:30.90 卵巣:436.70 精巣:110.80 心臓:55.80 骨格筋:142 食道:- 胃:- 腸:73.90 結腸:52.90     肝臓:45.30        肺:170.70    膀胱:- 腎臓:64.50 下垂体:25.80 甲状腺:112.50 副腎:- 膵臓:56.30 乳腺:101.20 唾液腺:108
GeneChip 子宮:10.02 胎盤:9.35 前立腺:10.15 卵巣:10.13 精巣:7.57 心臓:9.55 骨格筋:9.57 食道:- 胃:9.93 腸:9.86 結腸:- 肝臓:10.04 肺:9.96 膀胱:10.06 腎臓:10 下垂体:10.09 甲状腺:- 副腎:10.40 膵臓:10.05 乳腺:9.92 唾液腺:10.01
CAGE 子宮:3.19 胎盤:3.26 前立腺:3.33 卵巣:3.26 精巣:2.79 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:3.13 腸:3.25 結腸:2.94     肝臓:3.13    肺:3.36 膀胱:3.18 腎臓:- 下垂体:3.51 甲状腺:- 副腎:3.31 膵臓:3.71 乳腺:3.25 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:7.57 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:9.98        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001159750
Gene ID 21399
Unigene ID Mm.207263
Probe set ID 1419258_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000033813

オーソログ対応遺伝子

ヒト[2]  NM_006756, NM_201437
ラット[2]  NM_006756, NM_201437

染色体

1A1  [4,847,775  -  4,887,987]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR017923  TFIIS N-terminal
IPR003618  Transcription elongation factor S-II, central domain
IPR017890  Transcription elongation factor S-IIM
IPR016492  Transcription elongation factor, IIS
IPR006289  Transcription elongation factor, TFIIS
IPR014765  Transcription elongation factor, TFIIS/CRSP70, N-terminal
IPR003617  Transcription elongation factor, TFIIS/CRSP70, N-terminal, sub-type
IPR010990  Transcription elongation factor, TFIIS/elongin A/CRSP70, N-terminal

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1917889
3346229
8206389
9598303
10349636
10689187
10922068
11042159
11076861
11217851
11544199
12466851
12477932
12761297
15489334
15618518
16141072
16141073
16581793
16602821
18287559
19210546
20059953
20412781
22711520

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0030218  erythrocyte differentiation
GO:0045944  positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0045893  positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0032784  regulation of RNA elongation
GO:0006357  regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005730  nucleolus
GO:0005654  nucleoplasm
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0003677  DNA binding
GO:0046872  metal ion binding
GO:0003676  nucleic acid binding
GO:0005515  protein binding
GO:0008270  zinc ion binding