lysine (K)-specific demethylase 5A

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同義遺伝子名

C76986, jumonji, AT rich interactive domain 1A (Rbp2 like), RBP2, Jarid1a, MGC11659, Rbbp2, AA409370

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:3.50 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:141.90 網膜:32.10 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:10.80 末梢血:43.10 脾臓:26.30 胸腺:29.60 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:7.90
GeneChip 大脳:8.18 小脳:8.06 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:7.98 脊柱:7.96 網膜:8.30 目:8.02 動脈:- 静脈:8.71 リンパ節:9.03 末梢血:- 脾臓:8.83 胸腺:- 骨髄:8.42 脂肪:8.79 骨:9.11 皮膚:8.76
CAGE 大脳:3.22 小脳:- 脳幹:2.92 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:2.98 網膜:- 目:- 動脈:3.21 静脈:- リンパ節:3.73 末梢血:- 脾臓:3.40 胸腺:3.47 骨髄:- 脂肪:- 骨:2.88 皮膚:3.42
RNA-seq 大脳:1.85 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:87.20 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:12.90 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:9.40 乳腺:6.50 唾液腺:-
GeneChip 子宮:7.33 胎盤:9.47 前立腺:7.36 卵巣:8.96 精巣:7.69 心臓:8.23 骨格筋:8.37 食道:- 胃:6.89 腸:7.72 結腸:- 肝臓:8.04 肺:8.46 膀胱:8.66 腎臓:8.01 下垂体:8.99 甲状腺:- 副腎:8.70 膵臓:7.66 乳腺:8.61 唾液腺:8.02
CAGE 子宮:3.26 胎盤:3.36 前立腺:3.15 卵巣:3.38 精巣:3.11 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:1.57 腸:3.11 結腸:2.60     肝臓:2.90    肺:3.47 膀胱:3.12 腎臓:- 下垂体:3.38 甲状腺:- 副腎:3.24 膵臓:2.97 乳腺:3.14 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:1.66 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:2.36        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_145997
Gene ID 214899
Unigene ID Mm.404761
Probe set ID 1452360_a_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000030180

オーソログ対応遺伝子

ヒト[2]  NM_001042603
ラット[2]  NM_001042603

染色体

6F1  [120,314,117  -  120,394,592]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003347  Transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase
IPR019787  Zinc finger, PHD-finger
IPR001965  Zinc finger, PHD-type

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10349636
10725249
10922068
11042159
11076861
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16141073
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17320163
18022353
18287559
18483221
18799693
18995834
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20064375
20231316
20412781
21267068
21677750
21788502
21960634
23093672
23112189
24183668

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0016568  chromatin modification
GO:0007275  multicellular organismal development
GO:0055114  oxidation reduction
GO:0045893  positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0019907  cyclin-dependent protein kinase activating kinase holoenzyme complex
GO:0005737  cytoplasm
GO:0005622  intracellular
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0003682  chromatin binding
GO:0003677  DNA binding
GO:0046872  metal ion binding
GO:0016491  oxidoreductase activity
GO:0016706  oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, 2-oxoglutarate as one donor, and incorporation of one atom each of oxygen into both donors
GO:0016702  oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen
GO:0005515  protein binding
GO:0008270  zinc ion binding