sema domain, transmembrane domain (TM), and cytoplasmic domain, (semaphorin) 6D

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同義遺伝子名

Sema6D-6, D330011G23, Semaphorin-6D precursor, Sema6D-1, Sema6D-5, Kiaa1479, Sema6D-2, Sema6d, 1110067B02Rik, mKIAA1479, AA409156, Sema6D-4

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:81.60 小脳:36.80 脳幹:63.60 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:133.80 脊柱:- 網膜:- 目:30.40 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:26.30 胸腺:19.80 骨髄:- 脂肪:- 骨:12.50 皮膚:7.90
GeneChip 大脳:5.94 小脳:7.54 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:6.58 脊柱:7.20 網膜:4.54 目:4.81 動脈:- 静脈:5.19 リンパ節:5.87 末梢血:- 脾臓:5.79 胸腺:- 骨髄:5.62 脂肪:5.23 骨:5.37 皮膚:4.69
CAGE 大脳:3.38 小脳:- 脳幹:3.63 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:3.97 網膜:- 目:- 動脈:2.09 静脈:- リンパ節:3.07 末梢血:- 脾臓:2.94 胸腺:1.63 骨髄:- 脂肪:- 骨:2.37 皮膚:1.94
RNA-seq 大脳:4.49 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:11.50 精巣:14.80 心臓:74.40 骨格筋:35.50 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:72.40        肺:40.20    膀胱:- 腎臓:8.10 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:122 乳腺:6.50 唾液腺:54
GeneChip 子宮:5.08 胎盤:6.18 前立腺:4.40 卵巣:5.29 精巣:4.45 心臓:5.94 骨格筋:4.98 食道:- 胃:4.98 腸:6.05 結腸:- 肝臓:4.94 肺:5.66 膀胱:4.89 腎臓:4.72 下垂体:5.09 甲状腺:- 副腎:4.53 膵臓:4.91 乳腺:5.29 唾液腺:4.99
CAGE 子宮:2.12 胎盤:3.49 前立腺:1.02 卵巣:2.38 精巣:0 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:0.67 腸:3.40 結腸:2.50     肝臓:2.16    肺:3.38 膀胱:1.92 腎臓:- 下垂体:1.92 甲状腺:- 副腎:2.13 膵臓:0.84 乳腺:2.20 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:1.81 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:1.45        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_199240
Gene ID 214968
Unigene ID Mm.330536
Probe set ID 1448060_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000027200

オーソログ対応遺伝子

ヒト[6]  NM_001198999, NM_020858, NM_024966, NM_153616, NM_153617, NM_153618, NM_153619
ラット [0]  

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001627  Semaphorin/CD100 antigen
IPR015943  WD40/YVTN repeat-like-containing domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
10349636
10922068
11042159
11076861
11217851
12110693
12466851
12477932
12693553
14610273
14715272
14977921
15489334
15543137
16141072
16141073
16284245
16446784
16602821
17082620
17145500
18617019
18728195
18799693
19243017
20436479
20512151
21267068
21677750
21831918
21862448
22615585
22632726
23646199
24179230

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0030154  cell differentiation
GO:0007275  multicellular organismal development
GO:0014912  negative regulation of smooth muscle cell migration
GO:0007399  nervous system development
GO:0014911  positive regulation of smooth muscle cell migration
GO:0021591  ventricular system development

Cellular Component

GO:0005794  Golgi apparatus
GO:0016021  integral to membrane
GO:0016020  membrane
GO:0005886  plasma membrane

Molecular Function

GO:0005515  protein binding
GO:0004872  receptor activity
GO:0030215  semaphorin receptor binding