PHD finger protein 1

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同義遺伝子名

PHF2, Tctex-3, D17Ertd455e, mPCl1, Polycomblike 1, T-complex testis-expressed 3, mPcl1, Phf1, AW557215, PHD finger protein 1, Protein PHF1, Tctex3

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:43.40 小脳:73.70 脳幹:31.80 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:19.10 脊柱:94.60 網膜:64.30 目:38 動脈:337.60 静脈:- リンパ節:108 末梢血:14.40 脾臓:13.20 胸腺:29.60 骨髄:12.80 脂肪:- 骨:12.50 皮膚:31.70
GeneChip 大脳:7.65 小脳:7.60 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:7.79 脊柱:7.98 網膜:7.08 目:6.96 動脈:- 静脈:6.72 リンパ節:8.52 末梢血:- 脾臓:9.15 胸腺:- 骨髄:8.03 脂肪:7.61 骨:7.53 皮膚:6.88
CAGE 大脳:3.68 小脳:- 脳幹:3.99 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:3.69 網膜:- 目:- 動脈:3.58 静脈:- リンパ節:3.77 末梢血:- 脾臓:3.57 胸腺:3.62 骨髄:- 脂肪:- 骨:3.49 皮膚:3.23
RNA-seq 大脳:6.84 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:13.80 前立腺:- 卵巣:218.30 精巣:29.60 心臓:55.80 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:52.90     肝臓:9.10        肺:50.20    膀胱:- 腎臓:8.10 下垂体:38.80 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:9.40 乳腺:58.80 唾液腺:108
GeneChip 子宮:7.62 胎盤:6.97 前立腺:8.67 卵巣:8.05 精巣:9.80 心臓:7.65 骨格筋:7.50 食道:- 胃:7.45 腸:7.70 結腸:- 肝臓:7.61 肺:8.35 膀胱:7.57 腎臓:7.52 下垂体:8.74 甲状腺:- 副腎:8.24 膵臓:8.10 乳腺:7.35 唾液腺:8.02
CAGE 子宮:3.44 胎盤:3.13 前立腺:4.06 卵巣:3.67 精巣:4.85 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:3.48 腸:2.96 結腸:3.79     肝臓:3.28    肺:4.12 膀胱:3.81 腎臓:- 下垂体:4.47 甲状腺:- 副腎:3.91 膵臓:4.08 乳腺:2.87 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:2.38 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:2.90        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_009343
Gene ID 21652
Unigene ID Mm.258953
Probe set ID 1416542_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000024193

オーソログ対応遺伝子

ヒト[4]  NM_002636, NM_024165
ラット[1]  NM_212538, NM_024165

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR002999  Tudor domain
IPR001965  Zinc finger, PHD-type

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1718647
1731353
9799836
10341100
10349636
10545244
10725249
10922068
11042159
11076861
11217851
11466526
11559747
12466851
12477932
15618518
15782199
16141072
16141073
18287559
18799693
20059953
20123894
20211142
20412781
21267068
23104054

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0016568  chromatin modification
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006974  response to DNA damage stimulus
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0005856  cytoskeleton
GO:0035098  ESC/E(Z) complex
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0046872  metal ion binding
GO:0035064  methylated histone residue binding
GO:0005515  protein binding
GO:0008270  zinc ion binding