scaffold attachment factor B

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同義遺伝子名

HET, scaffold attachment factor B, 5330423C17Rik, AU018122, HAP, Safb, E130307D12, 3110021E02Rik, D18386, SAFB1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:55.60 小脳:- 脳幹:31.80 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:64.30 目:106.40 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:28.80 脾臓:26.30 胸腺:49.40 骨髄:25.60 脂肪:- 骨:87.70 皮膚:15.80
GeneChip 大脳:8.58 小脳:8.98 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:7.86 脊柱:8.23 網膜:8.02 目:7.34 動脈:- 静脈:8.01 リンパ節:8.52 末梢血:- 脾臓:8.95 胸腺:- 骨髄:9.07 脂肪:7.90 骨:8.32 皮膚:8.11
CAGE 大脳:4.40 小脳:- 脳幹:4.01 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:3.93 網膜:- 目:- 動脈:3.87 静脈:- リンパ節:4.57 末梢血:- 脾臓:3.96 胸腺:4.46 骨髄:- 脂肪:- 骨:4.25 皮膚:4.24
RNA-seq 大脳:10.69 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:43.60 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:103.40 精巣:22.20 心臓:93 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:52.90     肝臓:-        肺:30.10    膀胱:- 腎臓:48.40 下垂体:38.80 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:65.70 乳腺:52.20 唾液腺:-
GeneChip 子宮:9.08 胎盤:8.27 前立腺:8.61 卵巣:8.62 精巣:8.73 心臓:7.95 骨格筋:8.01 食道:- 胃:8.04 腸:8.50 結腸:- 肝臓:8.26 肺:8.45 膀胱:7.92 腎臓:7.98 下垂体:8.87 甲状腺:- 副腎:8.47 膵臓:7.62 乳腺:8.07 唾液腺:8.26
CAGE 子宮:4.01 胎盤:3.76 前立腺:3.71 卵巣:3.89 精巣:4.20 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:3.42 腸:3.88 結腸:3.81     肝臓:3.57    肺:3.96 膀胱:3.98 腎臓:- 下垂体:4.00 甲状腺:- 副腎:3.75 膵臓:3.99 乳腺:3.81 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:4.07 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:8.40        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001163300
Gene ID 224903
Unigene ID Mm.255066
Probe set ID 1454928_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000071054

オーソログ対応遺伝子

ヒト[2]  NM_001201338, NM_001201339, NM_001201340, NM_002967
ラット[2]  NM_001201338, NM_001201339, NM_001201340, NM_002967

染色体

17D  [56,724,405  -  56,745,717]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000504  RNA recognition motif, RNP-1

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
10349636
10725249
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
12520002
12904583
14610273
15066997
15741177
15798188
16033648
16141072
16141073
16326836
16602821
16912158
17931718
17967808
18799693
19267898
19403048
21267068
21464516
24457600

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0030520  estrogen receptor signaling pathway
GO:0040007  growth
GO:0042445  hormone metabolic process
GO:0045944  positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0050684  regulation of mRNA processing
GO:0006357  regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0003682  chromatin binding
GO:0003677  DNA binding
GO:0003676  nucleic acid binding
GO:0000166  nucleotide binding
GO:0005515  protein binding
GO:0019901  protein kinase binding
GO:0003723  RNA binding
GO:0043565  sequence-specific DNA binding