lysine (K)-specific demethylase 2A

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同義遺伝子名

Cxxc8, lalina, Kiaa1004, Fbxl11, F-box/LRR-repeat protein 11, Jhdm1a, Fbl7, Jhdm1, Fbl11, F-box and leucine-rich repeat protein 11

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip nodata
CAGE 大脳:3.20 小脳:- 脳幹:2.78 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:2.83 網膜:- 目:- 動脈:3.15 静脈:- リンパ節:2.58 末梢血:- 脾臓:3.17 胸腺:3.37 骨髄:- 脂肪:- 骨:2.72 皮膚:3.50
RNA-seq 大脳:5.00 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip nodata
CAGE 子宮:3.32 胎盤:3.01 前立腺:2.98 卵巣:3.05 精巣:2.79 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:2.44 腸:3.32 結腸:3.61     肝臓:2.60    肺:3.20 膀胱:3.04 腎臓:- 下垂体:3.05 甲状腺:- 副腎:3.13 膵臓:2.97 乳腺:3.12 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:2.58 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:3.31        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001001984
Gene ID 225876
Unigene ID -
Probe set ID -
Ensembl ID ENSMUSG00000054611

オーソログ対応遺伝子

ヒト[3]  NM_012308
ラット[1]  NM_001108515

染色体

19A  [4,316,170  -  4,398,266]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003347  Transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase
IPR019787  Zinc finger, PHD-finger
IPR001965  Zinc finger, PHD-type

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10349636
10531037
10922068
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
12520002
14610273
15033168
15368895
15489334
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16141072
16141073
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18022353
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20080798
20417597
21220025
21267068
21677750
22083960
22719268

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0016568  chromatin modification
GO:0070544  histone H3-K36 demethylation
GO:0055114  oxidation reduction
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0000790  nuclear chromatin
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0003677  DNA binding
GO:0051864  histone demethylase activity (H3-K36 specific)
GO:0046872  metal ion binding
GO:0016491  oxidoreductase activity
GO:0016702  oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen
GO:0045322  unmethylated CpG binding
GO:0008270  zinc ion binding