excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 5

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同義遺伝子名

Ercc-5, Ercc5, DNA excision repair protein ERCC-5, Xpg

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:7.06 小脳:7.23 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:7.27 脊柱:6.85 網膜:7.70 目:7.80 動脈:- 静脈:7.28 リンパ節:6.93 末梢血:- 脾臓:7.28 胸腺:- 骨髄:6.68 脂肪:7 骨:6.54 皮膚:8.15
CAGE 大脳:3.15 小脳:- 脳幹:2.99 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:2.91 網膜:- 目:- 動脈:3.35 静脈:- リンパ節:3.54 末梢血:- 脾臓:2.64 胸腺:3.14 骨髄:- 脂肪:- 骨:2.66 皮膚:3.57
RNA-seq 大脳:1.25 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:7.27 胎盤:6.96 前立腺:7.35 卵巣:7.39 精巣:7.54 心臓:7.29 骨格筋:7.54 食道:- 胃:6.83 腸:6.90 結腸:- 肝臓:7.42 肺:7.72 膀胱:7.44 腎臓:6.88 下垂体:8.73 甲状腺:- 副腎:7.82 膵臓:6.33 乳腺:7.31 唾液腺:7.36
CAGE 子宮:3.12 胎盤:2.69 前立腺:3.16 卵巣:3.26 精巣:1.60 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:2.85 腸:2.74 結腸:2.39     肝臓:3.08    肺:3.27 膀胱:3.24 腎臓:- 下垂体:3.95 甲状腺:- 副腎:2.93 膵臓:3.36 乳腺:2.98 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:1.72 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:2.77        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_011729
Gene ID 22592
Unigene ID -
Probe set ID 1450935_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000026048

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]  NM_000123, NM_001204425
ラット[1]  NM_001106910, NM_001204425

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR006084  DNA repair protein (XPGC)/yeast Rad
IPR001044  Xeroderma pigmentosum group G protein

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

7510366
7590748
8703115
8954777
9828143
10022922
10349636
10922068
11042159
11076861
11217851
11266544
11423996
11544199
12466851
12477932
14610273
14993263
15082767
15661658
16141072
16141073
16602821
20868484
21267068
22863773

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0008340  determination of adult lifespan
GO:0006281  DNA repair
GO:0035264  multicellular organism growth
GO:0043066  negative regulation of apoptosis
GO:0006289  nucleotide-excision repair
GO:0006295  nucleotide-excision repair, DNA incision, 3'-to lesion
GO:0006974  response to DNA damage stimulus
GO:0009411  response to UV
GO:0010225  response to UV-C
GO:0006283  transcription-coupled nucleotide-excision repair
GO:0009650  UV protection

Cellular Component

GO:0016591  DNA-directed RNA polymerase II, holoenzyme
GO:0005675  holo TFIIH complex
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0000405  bubble DNA binding
GO:0003824  catalytic activity
GO:0003677  DNA binding
GO:0003690  double-stranded DNA binding
GO:0004520  endodeoxyribonuclease activity
GO:0004519  endonuclease activity
GO:0016787  hydrolase activity
GO:0016788  hydrolase activity, acting on ester bonds
GO:0046872  metal ion binding
GO:0004518  nuclease activity
GO:0042803  protein homodimerization activity
GO:0047485  protein N-terminus binding
GO:0003697  single-stranded DNA binding