chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 1

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

RIKEN cDNA 4732435N03 gene, 4732435N03Rik, Galnact1, beta4GalNAcT-1, Chgn

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:41.70 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:283.70 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:86.30 脾臓:- 胸腺:9.90 骨髄:25.60 脂肪:- 骨:100.20 皮膚:47.50
GeneChip 大脳:5.59 小脳:4.47 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:5.84 脊柱:5.60 網膜:4.58 目:4.73 動脈:- 静脈:6.29 リンパ節:4.51 末梢血:- 脾臓:4.08 胸腺:- 骨髄:5.56 脂肪:4.59 骨:5.42 皮膚:5.14
CAGE 大脳:1.59 小脳:- 脳幹:1.68 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:1.76 網膜:- 目:- 動脈:1.67 静脈:- リンパ節:1.35 末梢血:- 脾臓:1.36 胸腺:1.06 骨髄:- 脂肪:- 骨:1.51 皮膚:2.70
RNA-seq 大脳:1.10 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:174.50 胎盤:- 前立腺:30.90 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:65.50 腸:- 結腸:52.90     肝臓:9.10        肺:40.20    膀胱:264.70 腎臓:24.20 下垂体:38.80 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:3.30 唾液腺:-
GeneChip 子宮:4.39 胎盤:5.44 前立腺:4.23 卵巣:4.62 精巣:4.16 心臓:4.71 骨格筋:4.88 食道:- 胃:4.24 腸:4 結腸:- 肝臓:4.30 肺:6.37 膀胱:4.43 腎臓:5.87 下垂体:6.44 甲状腺:- 副腎:4.37 膵臓:4.63 乳腺:4.45 唾液腺:5.30
CAGE 子宮:1.32 胎盤:1.41 前立腺:1.09 卵巣:1.38 精巣:0 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:1.07 腸:0 結腸:0.70     肝臓:0.64    肺:2.34 膀胱:1.01 腎臓:- 下垂体:3.16 甲状腺:- 副腎:1.12 膵臓:1.30 乳腺:0.99 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:1.50 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:1.10        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_172753
Gene ID 234356
Unigene ID Mm.334569
Probe set ID 1452365_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000036356

オーソログ対応遺伝子

ヒト[2]  NM_001130518, NM_018371
ラット[1]  NM_001107309, NM_018371

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10349636
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
14681479
15489334
16141072
16141073
17145758
18799693
20562862
20812917
21148564
21267068
21677750
22280990
22535667

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0051216  cartilage development
GO:0030206  chondroitin sulfate biosynthetic process
GO:0030204  chondroitin sulfate metabolic process
GO:0050653  chondroitin sulfate proteoglycan biosynthetic process, polysaccharide chain biosynthetic process
GO:0001958  endochondral ossification
GO:0030198  extracellular matrix organization
GO:0046398  UDP-glucuronate metabolic process
GO:0019276  UDP-N-acetylgalactosamine metabolic process

Cellular Component

GO:0005794  Golgi apparatus
GO:0032580  Golgi cisterna membrane
GO:0016021  integral to membrane
GO:0016020  membrane

Molecular Function

GO:0008376  acetylgalactosaminyltransferase activity
GO:0047238  glucuronosyl-N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 4-beta-N-acetylgalactosaminyltransferase activity
GO:0015020  glucuronosyltransferase activity
GO:0047237  glucuronylgalactosylproteoglycan 4-beta-N-acetylgalactosaminyltransferase activity
GO:0046872  metal ion binding
GO:0008955  peptidoglycan glycosyltransferase activity
GO:0016740  transferase activity
GO:0016758  transferase activity, transferring hexosyl groups