procollagen-lysine, 2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3

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同義遺伝子名

AI414586, Lysyl hydroxylase 3, Plod3, LH3, lysyl hydroxylase 3, procollagen-lysine, 2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:95.50 小脳:92.10 脳幹:127.10 脳梁:- 松果体:515.60 末梢神経:248.40 脊柱:141.90 網膜:128.60 目:53.20 動脈:337.60 静脈:- リンパ節:21.60 末梢血:186.90 脾臓:79 胸腺:69.20 骨髄:64.10 脂肪:212.70 骨:275.50 皮膚:102.90
GeneChip 大脳:8.46 小脳:8.49 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:8.88 脊柱:9.04 網膜:8.21 目:8.64 動脈:- 静脈:9.39 リンパ節:8.88 末梢血:- 脾臓:8.88 胸腺:- 骨髄:9.08 脂肪:9.27 骨:8.81 皮膚:8.34
CAGE 大脳:2.28 小脳:- 脳幹:2.46 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:2.51 網膜:- 目:- 動脈:3.23 静脈:- リンパ節:2.11 末梢血:- 脾臓:2.70 胸腺:1.57 骨髄:- 脂肪:- 骨:3.21 皮膚:2.70
RNA-seq 大脳:6.66 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:261.70 胎盤:234.70 前立腺:- 卵巣:68.90 精巣:44.30 心臓:37.20 骨格筋:35.50 食道:- 胃:229.10 腸:- 結腸:52.90     肝臓:45.30        肺:140.60    膀胱:198.50 腎臓:48.40 下垂体:64.60 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:28.10 乳腺:140.40 唾液腺:-
GeneChip 子宮:9.57 胎盤:10.56 前立腺:8.70 卵巣:9.54 精巣:8.41 心臓:9.12 骨格筋:8.82 食道:- 胃:8.94 腸:8.63 結腸:- 肝臓:9.08 肺:9.51 膀胱:8.97 腎臓:9.01 下垂体:9.03 甲状腺:- 副腎:9.03 膵臓:8.78 乳腺:9.12 唾液腺:8.92
CAGE 子宮:3.23 胎盤:4.03 前立腺:2.41 卵巣:3.05 精巣:1.18 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:3.05 腸:3.06 結腸:2.37     肝臓:3.21    肺:3.42 膀胱:2.84 腎臓:- 下垂体:2.35 甲状腺:- 副腎:2.84 膵臓:3.10 乳腺:3.65 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:3.26 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:4.91        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_011962
Gene ID 26433
Unigene ID Mm.251003
Probe set ID 1415901_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000004846

オーソログ対応遺伝子

ヒト [0]  
ラット [0]  

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR005123  Oxoglutarate/iron-dependent oxygenase
IPR006620  Prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
10349636
10429951
10922068
11042159
11076861
11130984
11217851
11334715
11896059
12466851
12477932
12904583
14610273
14681479
15377789
15489334
15782199
16141072
16141073
16447251
16467571
16996725
17873278
19696018
19713213
21220425
21267068
21677750
22573318
23209641
24457600

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0070831  basement membrane assembly
GO:0030199  collagen fibril organization
GO:0001886  endothelial cell morphogenesis
GO:0048730  epidermis morphogenesis
GO:0001701  in utero embryonic development
GO:0060425  lung morphogenesis
GO:0008152  metabolic process
GO:0021915  neural tube development
GO:0055114  oxidation reduction
GO:0008104  protein localization
GO:0042311  vasodilation

Cellular Component

GO:0005783  endoplasmic reticulum
GO:0016020  membrane

Molecular Function

GO:0005506  iron ion binding
GO:0031418  L-ascorbic acid binding
GO:0046872  metal ion binding
GO:0016491  oxidoreductase activity
GO:0016705  oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen
GO:0016706  oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, 2-oxoglutarate as one donor, and incorporation of one atom each of oxygen into both donors
GO:0016702  oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen
GO:0033823  procollagen glucosyltransferase activity
GO:0008475  procollagen-lysine 5-dioxygenase activity