vacuolar protein sorting 39 (yeast)

同義遺伝子名

A230065P22Rik, Pldn, vacuolar protein sorting 39 (yeast), Vps39, Vam6P, Vam6/Vps39-like protein, mVam6, AW743070, Vam6, Vps39 protein

正常組織・臓器 40分類
正常組織 (発生期含む)・初代培養細胞（FANTOM5 CAGE）

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:112.90

小脳:202.60

脳幹:63.60

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:57.30

脊柱:189.10

網膜:64.30

目:91.20

動脈:-

静脈:-

リンパ節:183.60

末梢血:28.80

脾臓:79

胸腺:118.60

骨髄:-

脂肪:-

骨:175.30

皮膚:39.60

GeneChip

大脳:7.27

小脳:7.44

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:7.05

脊柱:7.52

網膜:5.62

目:5.54

動脈:-

静脈:6.24

リンパ節:7.46

末梢血:-

脾臓:7.18

胸腺:-

骨髄:6.72

脂肪:6.83

骨:6.51

皮膚:6.67

CAGE

大脳:3.35

小脳:-

脳幹:3.68

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:3.75

網膜:-

目:-

動脈:3.05

静脈:-

リンパ節:3.17

末梢血:-

脾臓:2.76

胸腺:3.27

骨髄:-

脂肪:-

骨:3.25

皮膚:2.50

RNA-seq

大脳:6.41

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:87.20

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:46

精巣:29.60

心臓:55.80

骨格筋:35.50

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:17.60

肝臓:9.10

肺:110.50

膀胱:66.20

腎臓:16.10

下垂体:155

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:78.40

唾液腺:-

GeneChip

子宮:7.08

胎盤:6.78

前立腺:6.54

卵巣:6.99

精巣:7.06

心臓:7

骨格筋:6.88

食道:-

胃:6.73

腸:6.67

結腸:-

肝臓:6.84

肺:6.82

膀胱:6.68

腎臓:6.79

下垂体:7.48

甲状腺:-

副腎:6.42

膵臓:6.71

乳腺:6.66

唾液腺:6.34

CAGE

子宮:2.94

胎盤:2.70

前立腺:3.00

卵巣:3.17

精巣:3.45

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:2.79

腸:2.40

結腸:2.90

肝臓:2.43

肺:3.26

膀胱:3.01

腎臓:-

下垂体:3.44

甲状腺:-

副腎:3.17

膵臓:2.56

乳腺:2.90

唾液腺:-

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:2.12

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:2.25

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_178851
Gene ID	269338
Unigene ID	Mm.246131
Probe set ID	1425474_a_at [Mouse430_2]
Ensembl ID	ENSMUSG00000027291

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]	NM_015289
ラット[1]	NM_001012186

染色体

2E5 [120,142,197 - 120,178,873]

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- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0006886	intracellular protein transport
GO:0015031	protein transport
GO:0006810	transport
GO:0016192	vesicle-mediated transport

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0005768	endosome
GO:0030897	HOPS complex
GO:0005764	lysosome
GO:0016020	membrane

Molecular Function

GO:0005515	protein binding
GO:0005083	small GTPase regulator activity

vacuolar protein sorting 39 (yeast)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function