DEAD/H (Asp-Glu-Ala-Asp/His) box polypeptide 11 (CHL1-like helicase homolog, S. cerevisiae)

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同義遺伝子名

4732462I11Rik, DEAD/H box protein 11, CHL1, MGC90809, KRG2, Ddx11, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX11, CHLR1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip nodata
CAGE 大脳:0.95 小脳:- 脳幹:0.65 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:0.75 網膜:- 目:- 動脈:0.95 静脈:- リンパ節:2.20 末梢血:- 脾臓:2.26 胸腺:2.35 骨髄:- 脂肪:- 骨:1.97 皮膚:1.94
RNA-seq 大脳:1.09 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip nodata
CAGE 子宮:1.78 胎盤:0.58 前立腺:1.35 卵巣:1.79 精巣:3.29 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:1.57 腸:1.65 結腸:1.63     肝臓:1.22    肺:0.91 膀胱:1.41 腎臓:- 下垂体:1.31 甲状腺:- 副腎:1.26 膵臓:1.84 乳腺:1.36 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:0.82 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:1.68        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001003919
Gene ID 320209
Unigene ID -
Probe set ID -
Ensembl ID ENSMUSG00000035842

オーソログ対応遺伝子

ヒト[12]  NM_004399, NM_030653, NM_152438
ラット[12]  NM_004399, NM_030653, NM_152438

染色体

17E1.1  [66,472,860  -  66,501,507]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR010614  DEAD2
IPR013020  DNA helicase (DNA repair), Rad3 type
IPR014013  Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain, DinG/Rad3-type
IPR006554  Helicase-like, DEXD box c2 type

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10349636
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
12520002
12904583
14610273
15489334
15755804
16141072
16141073
17611414
18799693
21677750
21854770
22678773

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007049  cell cycle
GO:0032508  DNA duplex unwinding
GO:0006139  nucleobase, nucleoside, nucleotide and nucleic acid metabolic process
GO:0007062  sister chromatid cohesion

Cellular Component

GO:0030496  midbody
GO:0000790  nuclear chromatin
GO:0005634  nucleus
GO:0000922  spindle pole

Molecular Function

GO:0051539  4 iron, 4 sulfur cluster binding
GO:0005524  ATP binding
GO:0004003  ATP-dependent DNA helicase activity
GO:0008026  ATP-dependent helicase activity
GO:0003677  DNA binding
GO:0008094  DNA-dependent ATPase activity
GO:0004386  helicase activity
GO:0016787  hydrolase activity
GO:0016817  hydrolase activity, acting on acid anhydrides
GO:0016818  hydrolase activity, acting on acid anhydrides, in phosphorus-containing anhydrides
GO:0051536  iron-sulfur cluster binding
GO:0046872  metal ion binding
GO:0003676  nucleic acid binding
GO:0000166  nucleotide binding
GO:0003723  RNA binding