HLA-B-associated transcript 1A

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同義遺伝子名

D17H6S81E-1, MGC38799, D6S81Eh, Spliceosome RNA helicase Bat1, AI428441, Uap56, HLA-B-associated transcript 1, 56 kDa U2AF65-associated protein, D17H6S81E, MGC19235, 0610030D10Rik, HLA-B-associated transcript 1A, Bat-1, DEAD box protein UAP56, Bat1a

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:244.90 小脳:221 脳幹:31.80 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:382.20 脊柱:94.60 網膜:803.60 目:265.90 動脈:168.80 静脈:- リンパ節:399.70 末梢血:201.30 脾臓:645.20 胸腺:79 骨髄:282.10 脂肪:- 骨:175.30 皮膚:134.60
GeneChip 大脳:10.93 小脳:11.24 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:10.66 脊柱:10.67 網膜:9.64 目:9.07 動脈:- 静脈:10.88 リンパ節:11.94 末梢血:- 脾臓:12.13 胸腺:- 骨髄:11.84 脂肪:10.56 骨:11.26 皮膚:10.60
CAGE 大脳:5.34 小脳:- 脳幹:5.20 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:4.99 網膜:- 目:- 動脈:4.86 静脈:- リンパ節:5.74 末梢血:- 脾臓:5.58 胸腺:6.11 骨髄:- 脂肪:- 骨:5.54 皮膚:5.07
RNA-seq 大脳:34.03 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:261.70 胎盤:110.50 前立腺:123.50 卵巣:114.90 精巣:81.30 心臓:130.20 骨格筋:142 食道:- 胃:98.20 腸:110.90 結腸:70.50     肝臓:162.90        肺:291.20    膀胱:66.20 腎臓:257.90 下垂体:335.80 甲状腺:449.90 副腎:- 膵臓:168.90 乳腺:300.40 唾液腺:-
GeneChip 子宮:11.80 胎盤:10 前立腺:11.01 卵巣:11.85 精巣:10.06 心臓:10.15 骨格筋:10.70 食道:- 胃:10.77 腸:11.23 結腸:- 肝臓:10.08 肺:11.26 膀胱:10.70 腎臓:10.17 下垂体:11.79 甲状腺:- 副腎:11.14 膵臓:10.06 乳腺:11.06 唾液腺:10.71
CAGE 子宮:5.37 胎盤:4.94 前立腺:4.98 卵巣:5.44 精巣:5.02 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:5.12 腸:5.15 結腸:5.26     肝臓:4.58    肺:5.31 膀胱:5.02 腎臓:- 下垂体:5.32 甲状腺:- 副腎:5.08 膵臓:5.46 乳腺:4.88 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:13.10 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:8.14        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_019693
Gene ID 53817
Unigene ID Mm.439827
Probe set ID 1448221_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000019432

オーソログ対応遺伝子

ヒト[2]  NM_004640, NM_080598
ラット [0]  

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR014001  DEAD-like helicase, N-terminal
IPR014021  Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1684177
2228046
7601445
8119735
9021146
10349636
10469308
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
12520002
12904583
14610273
14656967
14691545
15489334
15782199
16141072
16141073
17967808
18799693
21327095
21637952
21677750
21859714
24457600

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0046784  intronless viral mRNA export from host nucleus
GO:0006406  mRNA export from nucleus
GO:0006397  mRNA processing
GO:0051028  mRNA transport
GO:0000398  nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0010501  RNA secondary structure unwinding
GO:0008380  RNA splicing
GO:0000245  spliceosome assembly
GO:0006810  transport

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0005634  nucleus
GO:0005681  spliceosomal complex
GO:0000346  transcription export complex
GO:0005687  U4 snRNP
GO:0005688  U6 snRNP

Molecular Function

GO:0005524  ATP binding
GO:0008026  ATP-dependent helicase activity
GO:0043008  ATP-dependent protein binding
GO:0004004  ATP-dependent RNA helicase activity
GO:0004386  helicase activity
GO:0016787  hydrolase activity
GO:0003676  nucleic acid binding
GO:0000166  nucleotide binding
GO:0003723  RNA binding
GO:0008186  RNA-dependent ATPase activity
GO:0030621  U4 snRNA binding
GO:0017070  U6 snRNA binding