kalirin, RhoGEF kinase

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同義遺伝子名

2210407G14Rik, TRAD, Kalrn, kalirin, RhoGEF kinase, DUET, AV235988, Gm539, Hapip, E530005C20Rik

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:- 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:32.10 目:7.60 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:19.80 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
GeneChip 大脳:10.70 小脳:7.57 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:5.24 脊柱:5.01 網膜:4.95 目:4.42 動脈:- 静脈:5.11 リンパ節:3.91 末梢血:- 脾臓:4.06 胸腺:- 骨髄:3.77 脂肪:3.96 骨:4.19 皮膚:3.90
CAGE 大脳:4.34 小脳:- 脳幹:3.06 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:2.31 網膜:- 目:- 動脈:1.89 静脈:- リンパ節:0.94 末梢血:- 脾臓:1.99 胸腺:0.82 骨髄:- 脂肪:- 骨:2.53 皮膚:3.03
RNA-seq 大脳:20.10 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:4.01 胎盤:3.97 前立腺:4.35 卵巣:4.37 精巣:4.03 心臓:4.23 骨格筋:4.37 食道:- 胃:3.88 腸:3.90 結腸:- 肝臓:4.22 肺:4.04 膀胱:4.32 腎臓:3.97 下垂体:3.84 甲状腺:- 副腎:4.77 膵臓:6.52 乳腺:4.04 唾液腺:4.28
CAGE 子宮:2.53 胎盤:2.15 前立腺:0.74 卵巣:2.06 精巣:0 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:3.36 腸:3.21 結腸:3.32     肝臓:3.18    肺:2.10 膀胱:1.97 腎臓:- 下垂体:1.81 甲状腺:- 副腎:1.02 膵臓:2.66 乳腺:0.67 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:2.82 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:3.68        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001164268
Gene ID 545156
Unigene ID Mm.450612
Probe set ID 1436066_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000061751

オーソログ対応遺伝子

ヒト[3]  NM_001024660, NM_003947, NM_007064
ラット [0]  

染色体

16B3  [33,974,344  -  34,573,618]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003961  Fibronectin, type III
IPR008957  Fibronectin, type III-like fold
IPR001849  Pleckstrin homology
IPR000719  Protein kinase, catalytic domain
IPR011009  Protein kinase-like domain
IPR002290  Serine/threonine-protein kinase domain
IPR017442  Serine/threonine-protein kinase-like domain
IPR018159  Spectrin/alpha-actinin
IPR001245  Tyrosine-protein kinase, catalytic domain
IPR020635  Tyrosine-protein kinase, subgroup, catalytic domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10349636
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21267068
21329509
21488700
21880917
22182308
22862288
23116210
23288169
23742124
23825406
23894151
24380811

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007409  axonogenesis
GO:0007399  nervous system development
GO:0016310  phosphorylation
GO:0006468  protein amino acid phosphorylation
GO:0050773  regulation of dendrite development
GO:0035023  regulation of Rho protein signal transduction

Cellular Component

GO:0043025  cell soma
GO:0005737  cytoplasm
GO:0005856  cytoskeleton
GO:0043005  neuron projection
GO:0048471  perinuclear region of cytoplasm

Molecular Function

GO:0005524  ATP binding
GO:0019899  enzyme binding
GO:0005085  guanyl-nucleotide exchange factor activity
GO:0016301  kinase activity
GO:0046872  metal ion binding
GO:0000166  nucleotide binding
GO:0005543  phospholipid binding
GO:0004672  protein kinase activity
GO:0004674  protein serine/threonine kinase activity
GO:0005089  Rho guanyl-nucleotide exchange factor activity
GO:0016740  transferase activity
GO:0016772  transferase activity, transferring phosphorus-containing groups