LPS-induced TN factor

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同義遺伝子名

NEDD4 WW domain-binding protein 3, TBX1, Estrogen-enhanced transcript protein, LPS-induced TNF-alpha factor homolog, C85531, N4WBP3, 3222402J11Rik, TBX1 protein, Litaf, Tbx1, Nedd4 WW domain-binding protein 3, LITAF-like protein, mEET, N4wbp3, LPS-induced TN factor

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:24.30 小脳:18.40 脳幹:95.30 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:57.30 脊柱:189.10 網膜:64.30 目:22.80 動脈:- 静脈:- リンパ節:75.60 末梢血:71.90 脾臓:65.80 胸腺:9.90 骨髄:282.10 脂肪:- 骨:187.90 皮膚:79.20
GeneChip 大脳:5.29 小脳:5.23 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:5.37 脊柱:5.54 網膜:5.48 目:5.96 動脈:- 静脈:5.76 リンパ節:5.54 末梢血:- 脾臓:5.49 胸腺:- 骨髄:5.53 脂肪:5.66 骨:5.61 皮膚:5.79
CAGE 大脳:3.61 小脳:- 脳幹:4.69 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:4.97 網膜:- 目:- 動脈:3.89 静脈:- リンパ節:5.03 末梢血:- 脾臓:4.38 胸腺:3.18 骨髄:- 脂肪:- 骨:4.98 皮膚:4.68
RNA-seq 大脳:6.24 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:130.90 胎盤:82.80 前立腺:30.90 卵巣:103.40 精巣:51.70 心臓:18.60 骨格筋:71 食道:- 胃:130.90 腸:37 結腸:211.50     肝臓:18.10        肺:180.80    膀胱:132.40 腎臓:64.50 下垂体:12.90 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:84.40 乳腺:310.20 唾液腺:54
GeneChip 子宮:5.57 胎盤:5.84 前立腺:5.49 卵巣:5.52 精巣:5.44 心臓:5.65 骨格筋:5.53 食道:- 胃:5.60 腸:5.66 結腸:- 肝臓:5.75 肺:5.61 膀胱:5.55 腎臓:5.58 下垂体:5.45 甲状腺:- 副腎:5.65 膵臓:6.11 乳腺:5.61 唾液腺:5.80
CAGE 子宮:5.19 胎盤:5.90 前立腺:3.92 卵巣:4.74 精巣:3.66 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:4.83 腸:5.45 結腸:5.32     肝臓:4.62    肺:4.58 膀胱:4.41 腎臓:- 下垂体:2.18 甲状腺:- 副腎:4.40 膵臓:5.02 乳腺:5.45 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:1.69 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:7.95        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_019980
Gene ID 56722
Unigene ID Mm.294753
Probe set ID 1448294_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000022500

オーソログ対応遺伝子

ヒト[6]  NM_001136472, NM_001136473, NM_004862
ラット[2]  NM_001105735, NM_001136473, NM_004862

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR006629  LPS-induced tumor necrosis factor alpha factor

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
10349636
10725249
10922068
11042109
11042159
11076861
11217851
11274176
12355436
12466851
12477932
12520002
12914755
14610273
14681479
15025820
15226823
15489334
15782199
15793005
16141072
16141073
16954198
18287559
18799693
20059953
20375622
21267068
21663590
21677750
21980379
21984950
22160695
22729949
23166352
23576546

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006915  apoptosis
GO:0071222  cellular response to lipopolysaccharide
GO:0042347  negative regulation of NF-kappaB import into nucleus
GO:0043123  positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB cascade
GO:0001817  regulation of cytokine production
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0032496  response to lipopolysaccharide
GO:0007165  signal transduction
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005794  Golgi apparatus
GO:0005765  lysosomal membrane
GO:0005764  lysosome
GO:0016020  membrane
GO:0005886  plasma membrane

Molecular Function

GO:0005515  protein binding
GO:0004871  signal transducer activity
GO:0050699  WW domain binding