aprataxin

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同義遺伝子名

aprataxin, Aprataxin homolog, Aptx, FHA-HIT, AA388047, 2410016G21Rik

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:33 小脳:73.70 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:38.20 脊柱:- 網膜:- 目:45.60 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:43.10 脾臓:- 胸腺:59.30 骨髄:12.80 脂肪:- 骨:- 皮膚:23.80
GeneChip 大脳:6.47 小脳:5.99 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:7.36 脊柱:6.44 網膜:5.51 目:5.65 動脈:- 静脈:6.32 リンパ節:6.49 末梢血:- 脾臓:6.02 胸腺:- 骨髄:5.99 脂肪:6.79 骨:5.86 皮膚:6.19
CAGE 大脳:2.76 小脳:- 脳幹:2.89 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:2.98 網膜:- 目:- 動脈:2.16 静脈:- リンパ節:2.81 末梢血:- 脾臓:2.14 胸腺:2.70 骨髄:- 脂肪:- 骨:1.51 皮膚:2.56
RNA-seq 大脳:3.87 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:43.60 胎盤:13.80 前立腺:- 卵巣:23 精巣:103.50 心臓:- 骨格筋:71 食道:- 胃:163.60 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:60.30    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:25.80 甲状腺:224.90 副腎:- 膵臓:18.80 乳腺:42.40 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.19 胎盤:6.80 前立腺:6.69 卵巣:6.35 精巣:10.29 心臓:6.06 骨格筋:7.01 食道:- 胃:5.87 腸:5.75 結腸:- 肝臓:6.20 肺:6.20 膀胱:6.35 腎臓:6.01 下垂体:6.30 甲状腺:- 副腎:5.94 膵臓:5.45 乳腺:6.55 唾液腺:6.01
CAGE 子宮:2.00 胎盤:2.51 前立腺:2.17 卵巣:2.40 精巣:5.19 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:2.36 腸:2.19 結腸:2.44     肝臓:2.16    肺:2.51 膀胱:2.49 腎臓:- 下垂体:2.75 甲状腺:- 副腎:2.35 膵臓:2.03 乳腺:2.33 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:4.68 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:2.06        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001025444
Gene ID 66408
Unigene ID Mm.430710
Probe set ID 1450921_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000028411

オーソログ対応遺伝子

ヒト[2]  NM_001195248, NM_001195249, NM_001195250, NM_001195251, NM_001195252, NM_001195254, NM_175069, NM_175073
ラット[1]  NM_148889, NM_001195249, NM_001195250, NM_001195251, NM_001195252, NM_001195254, NM_175069, NM_175073

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
10349636
11042159
11076861
11217851
11586299
11586300
12466851
12477932
14610273
15489334
16141072
16141073
16602821
16919269
16964241
17967808
18799693
19103743
19303373
20008512
21267068
21390131

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006266  DNA ligation
GO:0006281  DNA repair
GO:0006302  double-strand break repair
GO:0031647  regulation of protein stability
GO:0006974  response to DNA damage stimulus
GO:0042542  response to hydrogen peroxide
GO:0000012  single strand break repair

Cellular Component

GO:0000785  chromatin
GO:0000790  nuclear chromatin
GO:0005730  nucleolus
GO:0005654  nucleoplasm
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0003824  catalytic activity
GO:0003682  chromatin binding
GO:0003684  damaged DNA binding
GO:0033699  DNA 5'-adenosine monophosphate hydrolase activity
GO:0003677  DNA binding
GO:0003690  double-stranded DNA binding
GO:0003725  double-stranded RNA binding
GO:0016787  hydrolase activity
GO:0046872  metal ion binding
GO:0008967  phosphoglycolate phosphatase activity
GO:0051219  phosphoprotein binding
GO:0046403  polynucleotide 3'-phosphatase activity
GO:0047485  protein N-terminus binding