LSM1 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae)

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同義遺伝子名

CASM, Lsm1, 2810025O06Rik, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm1

正常組織・臓器 40分類
正常組織 (発生期含む)・初代培養細胞（FANTOM5 CAGE）

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:36.50

小脳:92.10

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:141.90

網膜:32.10

目:53.20

動脈:84.40

静脈:-

リンパ節:64.80

末梢血:14.40

脾臓:26.30

胸腺:88.90

骨髄:38.50

脂肪:-

骨:25

皮膚:39.60

GeneChip

大脳:7.54

小脳:7.38

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:7.97

脊柱:7.41

網膜:6.47

目:6.85

動脈:-

静脈:7.08

リンパ節:7.79

末梢血:-

脾臓:7.59

胸腺:-

骨髄:7.52

脂肪:8.18

骨:7.46

皮膚:7.03

CAGE

大脳:2.94

小脳:-

脳幹:3.06

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:2.81

網膜:-

目:-

動脈:2.65

静脈:-

リンパ節:2.77

末梢血:-

脾臓:3.00

胸腺:3.29

骨髄:-

脂肪:-

骨:3.02

皮膚:2.46

RNA-seq

大脳:5.04

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:87.20

胎盤:55.20

前立腺:-

卵巣:-

精巣:81.30

心臓:55.80

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:147.90

結腸:17.60

肝臓:27.20

肺:30.10

膀胱:198.50

腎臓:56.40

下垂体:25.80

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:18.80

乳腺:49

唾液腺:-

GeneChip

子宮:7.56

胎盤:7.63

前立腺:7.61

卵巣:7.89

精巣:7.82

心臓:7.37

骨格筋:7.38

食道:-

胃:7.27

腸:7.89

結腸:-

肝臓:7.82

肺:6.98

膀胱:7.47

腎臓:7.43

下垂体:7.55

甲状腺:-

副腎:7.84

膵臓:7.32

乳腺:7.54

唾液腺:7.01

CAGE

子宮:2.68

胎盤:3.02

前立腺:2.83

卵巣:2.89

精巣:3.64

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:2.73

腸:2.97

結腸:2.92

肝臓:3.17

肺:2.31

膀胱:2.97

腎臓:-

下垂体:2.96

甲状腺:-

副腎:2.98

膵臓:2.83

乳腺:2.69

唾液腺:-

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:3.96

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:3.60

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_026032
Gene ID	67207
Unigene ID	Mm.30198
Probe set ID	1423873_at [Mouse430_2]
Ensembl ID	ENSMUSG00000037296

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]	NM_014462
ラット[1]	NM_001108876

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001163	Like-Sm ribonucleoprotein (LSM) domain
IPR006649	Like-Sm ribonucleoprotein (LSM) domain, eukaryotic/archaea-type

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0071044	histone mRNA catabolic process
GO:0006397	mRNA processing
GO:0008380	RNA splicing

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0005634	nucleus
GO:0030529	ribonucleoprotein complex

Molecular Function

GO:0003674	molecular_function
GO:0003723	RNA binding

LSM1 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function