PRP6 pre-mRNA splicing factor 6 homolog (yeast)

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同義遺伝子名

Prpf6, 2610031L17Rik, 1190003A07Rik, ANT-1, U5 snRNP-associated 102 kDa protein, MGC11655, U5-102K, U5-102 kDa protein, PRP6 pre-mRNA splicing factor 6 homolog (yeast), MGC36967, MGC38351, Pre-mRNA-processing factor 6 homolog

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:118.10 小脳:55.30 脳幹:31.80 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:94.60 網膜:64.30 目:197.60 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:115 脾臓:26.30 胸腺:128.40 骨髄:38.50 脂肪:212.70 骨:- 皮膚:118.80
GeneChip 大脳:8.52 小脳:8.76 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:8.54 脊柱:8.31 網膜:8.96 目:8.69 動脈:- 静脈:8.50 リンパ節:8.93 末梢血:- 脾臓:8.80 胸腺:- 骨髄:8.70 脂肪:8.79 骨:8.38 皮膚:8.23
CAGE 大脳:4.42 小脳:- 脳幹:4.29 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:4.30 網膜:- 目:- 動脈:4.44 静脈:- リンパ節:4.90 末梢血:- 脾臓:4.22 胸腺:4.44 骨髄:- 脂肪:- 骨:3.89 皮膚:4.41
RNA-seq 大脳:10.04 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:43.60 胎盤:234.70 前立腺:30.90 卵巣:287.30 精巣:206.90 心臓:55.80 骨格筋:142 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:17.60     肝臓:18.10        肺:110.50    膀胱:- 腎臓:80.60 下垂体:155 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:131.40 乳腺:75.10 唾液腺:-
GeneChip 子宮:9.17 胎盤:9.04 前立腺:9.17 卵巣:9.13 精巣:8.58 心臓:8.25 骨格筋:8.55 食道:- 胃:8.45 腸:8.53 結腸:- 肝臓:9.33 肺:8.59 膀胱:8.76 腎臓:8.54 下垂体:9.19 甲状腺:- 副腎:8.72 膵臓:8.41 乳腺:8.67 唾液腺:8.02
CAGE 子宮:4.40 胎盤:4.17 前立腺:4.47 卵巣:4.43 精巣:4.97 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:4.11 腸:4.01 結腸:4.04     肝臓:4.44    肺:4.23 膀胱:4.37 腎臓:- 下垂体:4.63 甲状腺:- 副腎:4.37 膵臓:3.89 乳腺:4.04 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:5.69 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:8.78        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_133701
Gene ID 68879
Unigene ID Mm.292001
Probe set ID 1424036_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000002455

オーソログ対応遺伝子

ヒト[2]  NM_012469
ラット[1]  NM_001079766

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR019734  Tetratricopeptide repeat

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10349636
10922068
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
12520002
14610273
15489334
15782199
16033648
16141072
16141073
16414017
18799693
22922362
24457600

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0000244  assembly of spliceosomal tri-snRNP
GO:0006397  mRNA processing
GO:0000398  nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0045944  positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006403  RNA localization
GO:0006396  RNA processing
GO:0008380  RNA splicing

Cellular Component

GO:0071013  catalytic step 2 spliceosome
GO:0005622  intracellular
GO:0005634  nucleus
GO:0005681  spliceosomal complex
GO:0071001  U4/U6 snRNP
GO:0046540  U4/U6 x U5 tri-snRNP complex
GO:0005682  U5 snRNP

Molecular Function

GO:0050681  androgen receptor binding
GO:0043021  ribonucleoprotein binding
GO:0003723  RNA binding
GO:0003713  transcription coactivator activity