interferon induced with helicase C domain 1

同義遺伝子名

Melanoma differentiation-associated protein 5, MDA5, Helicase with 2 CARD domains, interferon induced with helicase C domain 1, 9130009C22Rik, Helicard, MGC90959, Hlcd, MDA-5, Ifih1

正常組織・臓器 40分類
正常組織 (発生期含む)・初代培養細胞（FANTOM5 CAGE）

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:6.90

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:32.10

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:10.80

末梢血:-

脾臓:237

胸腺:79

骨髄:346.20

脂肪:-

骨:-

皮膚:39.60

GeneChip

大脳:5.34

小脳:5.37

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:6.35

脊柱:5.57

網膜:7.18

目:8.34

動脈:-

静脈:6.38

リンパ節:8.69

末梢血:-

脾臓:7.85

胸腺:-

骨髄:8.57

脂肪:8.01

骨:8.62

皮膚:8.23

CAGE

大脳:0.91

小脳:-

脳幹:1.38

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:1.79

網膜:-

目:-

動脈:3.15

静脈:-

リンパ節:3.52

末梢血:-

脾臓:3.14

胸腺:2.64

骨髄:-

脂肪:-

骨:3.06

皮膚:2.86

RNA-seq

大脳:1.22

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:27.60

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:35.50

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:70.50

肝臓:18.10

肺:50.20

膀胱:132.40

腎臓:48.40

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:9.40

乳腺:71.80

唾液腺:-

GeneChip

子宮:8.32

胎盤:9.17

前立腺:8.74

卵巣:7.76

精巣:5.07

心臓:6.64

骨格筋:7.01

食道:-

胃:8.33

腸:9.58

結腸:-

肝臓:9.08

肺:8.64

膀胱:7.66

腎臓:7.28

下垂体:7.58

甲状腺:-

副腎:7.71

膵臓:6.49

乳腺:8.34

唾液腺:9.29

CAGE

子宮:3.17

胎盤:2.92

前立腺:2.43

卵巣:2.57

精巣:0

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:2.26

腸:3.84

結腸:3.88

肝臓:2.80

肺:3.41

膀胱:2.81

腎臓:-

下垂体:2.58

甲状腺:-

副腎:2.68

膵臓:2.03

乳腺:2.99

唾液腺:-

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:2.03

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:3.26

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001164477
Gene ID	71586
Unigene ID	Mm.136224
Probe set ID	1426276_at [Mouse430_2]
Ensembl ID	ENSMUSG00000026896

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]	NM_022168
ラット[1]	NM_001109199

染色体

2C1.3 [62,433,850 - 62,484,312]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR014001	DEAD-like helicase, N-terminal
IPR014021	Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0051607	defense response to virus
GO:0045087	innate immune response
GO:0032727	positive regulation of interferon-alpha production
GO:0032728	positive regulation of interferon-beta production
GO:0016925	protein sumoylation
GO:0042981	regulation of apoptosis
GO:0009615	response to virus

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0005622	intracellular
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0005524	ATP binding
GO:0003677	DNA binding
GO:0003725	double-stranded RNA binding
GO:0004386	helicase activity
GO:0016787	hydrolase activity
GO:0016817	hydrolase activity, acting on acid anhydrides
GO:0046872	metal ion binding
GO:0003676	nucleic acid binding
GO:0000166	nucleotide binding
GO:0005515	protein binding
GO:0043021	ribonucleoprotein binding
GO:0003723	RNA binding
GO:0003727	single-stranded RNA binding
GO:0008270	zinc ion binding

interferon induced with helicase C domain 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function