excision repaiross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 8

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同義遺伝子名

Ckn1, Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, B130065P18Rik, 2810431L23Rik, Csa, 4631412O06Rik, 2410022P04Rik, Cockayne syndrome WD repeat protein CSA homolog

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:19.10 小脳:294.70 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:172 脊柱:- 網膜:64.30 目:30.40 動脈:84.40 静脈:- リンパ節:21.60 末梢血:86.30 脾臓:263.30 胸腺:69.20 骨髄:- 脂肪:- 骨:25 皮膚:7.90
GeneChip 大脳:5.79 小脳:6.05 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:5.45 脊柱:5.79 網膜:4.66 目:4.79 動脈:- 静脈:5.49 リンパ節:6.08 末梢血:- 脾臓:5.54 胸腺:- 骨髄:6.65 脂肪:5.46 骨:6.38 皮膚:5.54
CAGE 大脳:3.04 小脳:- 脳幹:2.58 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:2.57 網膜:- 目:- 動脈:1.98 静脈:- リンパ節:2.69 末梢血:- 脾臓:2.37 胸腺:2.54 骨髄:- 脂肪:- 骨:2.09 皮膚:2.19
RNA-seq 大脳:2.13 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:43.60 胎盤:27.60 前立腺:- 卵巣:- 精巣:36.90 心臓:55.80 骨格筋:106.50 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:35.20     肝臓:-        肺:70.30    膀胱:- 腎臓:24.20 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:16.30 唾液腺:-
GeneChip 子宮:5.39 胎盤:5.57 前立腺:5.49 卵巣:5.29 精巣:7.79 心臓:5.10 骨格筋:5.49 食道:- 胃:5.46 腸:5.62 結腸:- 肝臓:5.78 肺:5.19 膀胱:5.49 腎臓:5.43 下垂体:4.92 甲状腺:- 副腎:4.70 膵臓:5.23 乳腺:5.72 唾液腺:4.82
CAGE 子宮:2.32 胎盤:1.91 前立腺:2.52 卵巣:2.11 精巣:4.41 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:1.91 腸:2.52 結腸:2.22     肝臓:2.43    肺:2.43 膀胱:1.86 腎臓:- 下垂体:2.25 甲状腺:- 副腎:2.17 膵臓:2.56 乳腺:2.51 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:1.67 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:1.63        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_028042
Gene ID 71991
Unigene ID Mm.212208
Probe set ID 1432249_a_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000021694

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]  NM_000082
ラット[1]  NM_001107650

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR020472  G-protein beta WD-40 repeat, region
IPR001680  WD40 repeat
IPR019782  WD40 repeat 2
IPR019781  WD40 repeat, subgroup
IPR011046  WD40 repeat-like-containing domain
IPR017986  WD40-repeat-containing domain
IPR015943  WD40/YVTN repeat-like-containing domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
10349636
11042159
11076861
11217851
12466851
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14681479
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16141073
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20100872
20211142
21267068
22174697

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006281  DNA repair
GO:0006289  nucleotide-excision repair
GO:0045739  positive regulation of DNA repair
GO:0043161  proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process
GO:0051865  protein autoubiquitination
GO:0000209  protein polyubiquitination
GO:0006974  response to DNA damage stimulus
GO:0006979  response to oxidative stress
GO:0009411  response to UV
GO:0010165  response to X-ray
GO:0006283  transcription-coupled nucleotide-excision repair

Cellular Component

GO:0031464  Cul4A-RING ubiquitin ligase complex
GO:0016363  nuclear matrix
GO:0000109  nucleotide-excision repair complex
GO:0005634  nucleus
GO:0043234  protein complex

Molecular Function

GO:0032403  protein complex binding
GO:0004842  ubiquitin-protein ligase activity