prolyl 4-hydroxylase, transmembrane (endoplasmic reticulum)

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同義遺伝子名

BB128974, Putative HIF-prolyl hydroxylase PH-4, Ph-4, Hypoxia-inducible factor prolyl 4-hydroxylase, MGC130597, AI853847, RIKEN cDNA 4933406E20 gene, Ph4, 4933406E20Rik

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:95.50 小脳:147.40 脳幹:349.60 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:133.80 脊柱:378.30 網膜:96.40 目:15.20 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:26.30 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:15.80
GeneChip nodata
CAGE 大脳:3.48 小脳:- 脳幹:3.50 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:3.44 網膜:- 目:- 動脈:1.32 静脈:- リンパ節:1.35 末梢血:- 脾臓:0.52 胸腺:1.06 骨髄:- 脂肪:- 骨:1.30 皮膚:0.60
RNA-seq 大脳:13.52 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:87.20 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:22.20 心臓:18.60 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:25.80 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:28.10 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:2.00 胎盤:0.63 前立腺:1.35 卵巣:1.88 精巣:1.89 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:1.35 腸:0.58 結腸:0.57     肝臓:0    肺:2.23 膀胱:2.10 腎臓:- 下垂体:2.98 甲状腺:- 副腎:1.82 膵臓:0.84 乳腺:0.49 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:1.52 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:0        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

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IDs

Refseq ID NM_028944
Gene ID 74443
Unigene ID Mm.226534
Probe set ID -
Ensembl ID ENSMUSG00000006675

オーソログ対応遺伝子

ヒト[2]  NM_177938, NM_177939
ラット[2]  NM_177938, NM_177939

染色体

9F2  [108,481,157  -  108,499,931]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR005123  Oxoglutarate/iron-dependent oxygenase
IPR006620  Prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
10349636
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
12520002
14610273
16141072
16141073
18799693
20075561
20185832
21267068

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0055114  oxidation reduction

Cellular Component

GO:0005575  cellular_component
GO:0005783  endoplasmic reticulum
GO:0016021  integral to membrane
GO:0016020  membrane

Molecular Function

GO:0005509  calcium ion binding
GO:0005506  iron ion binding
GO:0031418  L-ascorbic acid binding
GO:0046872  metal ion binding
GO:0003674  molecular_function
GO:0016491  oxidoreductase activity
GO:0016705  oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen
GO:0016706  oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, 2-oxoglutarate as one donor, and incorporation of one atom each of oxygen into both donors
GO:0016702  oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen