lysine (K)-specific demethylase 5B

同義遺伝子名

D1Ertd202e, 2210016I17Rik, 2010009J12Rik, mKIAA4034, Plu1, Rb-Bp2, Jarid1b, RBBP2H1A, jumonji, AT rich interactive domain 1B (Rbp2 like), PLU-1, KIAA4034, AW556288, PUT1

正常組織・臓器 40分類
正常組織 (発生期含む)・初代培養細胞（FANTOM5 CAGE）

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:187.60

小脳:55.30

脳幹:31.80

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:38.20

脊柱:141.90

網膜:64.30

目:182.40

動脈:253.20

静脈:-

リンパ節:10.80

末梢血:71.90

脾臓:-

胸腺:148.20

骨髄:-

脂肪:-

骨:37.60

皮膚:71.30

GeneChip

大脳:6.80

小脳:6.33

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:6.48

脊柱:6.09

網膜:8.03

目:7.70

動脈:-

静脈:7.54

リンパ節:5.95

末梢血:-

脾臓:5.86

胸腺:-

骨髄:6.06

脂肪:6.37

骨:6.33

皮膚:6.86

CAGE

大脳:3.86

小脳:-

脳幹:3.62

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:3.40

網膜:-

目:-

動脈:3.36

静脈:-

リンパ節:3.80

末梢血:-

脾臓:3.22

胸腺:4.46

骨髄:-

脂肪:-

骨:3.57

皮膚:4.68

RNA-seq

大脳:4.23

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:174.50

胎盤:96.70

前立腺:92.60

卵巣:80.40

精巣:325.10

心臓:74.40

骨格筋:35.50

食道:-

胃:98.20

腸:37

結腸:17.60

肝臓:9.10

肺:20.10

膀胱:-

腎臓:40.30

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:150.10

乳腺:42.40

唾液腺:-

GeneChip

子宮:6.89

胎盤:7.09

前立腺:7.01

卵巣:6.68

精巣:8.51

心臓:6.22

骨格筋:5.98

食道:-

胃:6.21

腸:6.36

結腸:-

肝臓:6.29

肺:6.19

膀胱:7.18

腎臓:6.07

下垂体:6.87

甲状腺:-

副腎:6.69

膵臓:6.03

乳腺:6.24

唾液腺:6.94

CAGE

子宮:4.18

胎盤:4.11

前立腺:3.98

卵巣:4.24

精巣:5.65

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:3.05

腸:4.09

結腸:3.82

肝臓:2.74

肺:3.75

膀胱:4.52

腎臓:-

下垂体:4.12

甲状腺:-

副腎:3.83

膵臓:3.86

乳腺:3.47

唾液腺:-

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:1.87

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:3.52

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_152895
Gene ID	75605
Unigene ID	Mm.28995
Probe set ID	1427142_s_at [Mouse430_2]
Ensembl ID	ENSMUSG00000042207

オーソログ対応遺伝子

ヒト[4]	NM_006618
ラット[1]	NM_001107177

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003347	Transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase
IPR019787	Zinc finger, PHD-finger
IPR001965	Zinc finger, PHD-type

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0016568	chromatin modification
GO:0034720	histone H3-K4 demethylation
GO:0034721	histone H3-K4 demethylation, trimethyl-H3-K4-specific
GO:0045892	negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0055114	oxidation reduction
GO:0006355	regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351	transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005622	intracellular
GO:0043231	intracellular membrane-bounded organelle
GO:0005730	nucleolus
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0003677	DNA binding
GO:0034648	histone demethylase activity (H3-dimethyl-K4 specific)
GO:0032453	histone demethylase activity (H3-K4 specific)
GO:0034647	histone demethylase activity (H3-trimethyl-K4 specific)
GO:0046872	metal ion binding
GO:0016491	oxidoreductase activity
GO:0016706	oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, 2-oxoglutarate as one donor, and incorporation of one atom each of oxygen into both donors
GO:0016702	oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen
GO:0003714	transcription corepressor activity
GO:0008270	zinc ion binding

lysine (K)-specific demethylase 5B

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function