lysine (K)-specific demethylase 5B

同義遺伝子名

D1Ertd202e, 2210016I17Rik, 2010009J12Rik, mKIAA4034, Plu1, Rb-Bp2, Jarid1b, RBBP2H1A, jumonji, AT rich interactive domain 1B (Rbp2 like), PLU-1, KIAA4034, AW556288, PUT1

正常組織・臓器 40分類
正常組織 (発生期含む)・初代培養細胞（FANTOM5 CAGE）

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:-

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:7.60

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:39.50

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

GeneChip

大脳:8.93

小脳:8.54

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:8.15

脊柱:7.89

網膜:9.67

目:8.76

動脈:-

静脈:9.70

リンパ節:8.39

末梢血:-

脾臓:7.98

胸腺:-

骨髄:8.44

脂肪:8.08

骨:8.02

皮膚:9.46

CAGE

大脳:3.86

小脳:-

脳幹:3.62

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:3.40

網膜:-

目:-

動脈:3.36

静脈:-

リンパ節:3.80

末梢血:-

脾臓:3.22

胸腺:4.46

骨髄:-

脂肪:-

骨:3.57

皮膚:4.68

RNA-seq

大脳:4.23

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:-

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:18.80

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:8.69

胎盤:9.33

前立腺:8.90

卵巣:9.20

精巣:10.49

心臓:7.55

骨格筋:7.48

食道:-

胃:8.14

腸:8.37

結腸:-

肝臓:7.95

肺:8.47

膀胱:9.66

腎臓:7.64

下垂体:9.36

甲状腺:-

副腎:8.83

膵臓:8.35

乳腺:8.52

唾液腺:8.81

CAGE

子宮:4.18

胎盤:4.11

前立腺:3.98

卵巣:4.24

精巣:5.65

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:3.05

腸:4.09

結腸:3.82

肝臓:2.74

肺:3.75

膀胱:4.52

腎臓:-

下垂体:4.12

甲状腺:-

副腎:3.83

膵臓:3.86

乳腺:3.47

唾液腺:-

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:1.87

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:3.52

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_152895
Gene ID	75605
Unigene ID	Mm.391994
Probe set ID	1427143_at [Mouse430_2]
Ensembl ID	ENSMUSG00000042207

オーソログ対応遺伝子

ヒト[4]	NM_006618
ラット[1]	NM_001107177

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003347	Transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase
IPR019787	Zinc finger, PHD-finger
IPR001965	Zinc finger, PHD-type

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0016568	chromatin modification
GO:0034720	histone H3-K4 demethylation
GO:0034721	histone H3-K4 demethylation, trimethyl-H3-K4-specific
GO:0045892	negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0055114	oxidation reduction
GO:0006355	regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351	transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005622	intracellular
GO:0043231	intracellular membrane-bounded organelle
GO:0005730	nucleolus
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0003677	DNA binding
GO:0034648	histone demethylase activity (H3-dimethyl-K4 specific)
GO:0032453	histone demethylase activity (H3-K4 specific)
GO:0034647	histone demethylase activity (H3-trimethyl-K4 specific)
GO:0046872	metal ion binding
GO:0016491	oxidoreductase activity
GO:0016706	oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, 2-oxoglutarate as one donor, and incorporation of one atom each of oxygen into both donors
GO:0016702	oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen
GO:0003714	transcription corepressor activity
GO:0008270	zinc ion binding

lysine (K)-specific demethylase 5B

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function