survival motor neuron domain containing 1

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同義遺伝子名

30 kDa splicing factor SMNrp, MGC106917, Smndc1, 4933440I19Rik, Spf30, Smnr, Survival motor neuron domain-containing protein 1, SMN-related protein, 2410004J23Rik, survival motor neuron domain containing 1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:43.40 小脳:36.80 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:57.30 脊柱:- 網膜:96.40 目:30.40 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:560.70 脾臓:92.20 胸腺:39.50 骨髄:64.10 脂肪:- 骨:50.10 皮膚:23.80
GeneChip 大脳:8.01 小脳:7.91 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:7.89 脊柱:7.86 網膜:6.84 目:7.33 動脈:- 静脈:8.35 リンパ節:9.20 末梢血:- 脾臓:8.93 胸腺:- 骨髄:9.22 脂肪:8.15 骨:8.79 皮膚:7.84
CAGE 大脳:3.96 小脳:- 脳幹:3.79 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:3.83 網膜:- 目:- 動脈:4.11 静脈:- リンパ節:4.83 末梢血:- 脾臓:4.01 胸腺:4.24 骨髄:- 脂肪:- 骨:3.57 皮膚:4.17
RNA-seq 大脳:6.14 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:96.70 前立腺:92.60 卵巣:- 精巣:51.70 心臓:18.60 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:17.60     肝臓:36.20        肺:30.10    膀胱:- 腎臓:64.50 下垂体:38.80 甲状腺:112.50 副腎:- 膵臓:84.40 乳腺:26.10 唾液腺:108
GeneChip 子宮:8.66 胎盤:9.47 前立腺:8.17 卵巣:8.52 精巣:9.11 心臓:8.27 骨格筋:8.53 食道:- 胃:8.41 腸:8.72 結腸:- 肝臓:8.03 肺:8.76 膀胱:8.46 腎臓:8.11 下垂体:8.29 甲状腺:- 副腎:8.07 膵臓:7.30 乳腺:8.32 唾液腺:7.27
CAGE 子宮:3.87 胎盤:4.28 前立腺:3.66 卵巣:3.80 精巣:4.41 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:3.94 腸:3.69 結腸:3.64     肝臓:3.17    肺:4.17 膀胱:3.92 腎臓:- 下垂体:3.68 甲状腺:- 副腎:3.73 膵臓:2.97 乳腺:3.68 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:4.03 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:3.38        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_172429
Gene ID 76479
Unigene ID Mm.313687
Probe set ID 1452999_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000025024

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]  NM_005871
ラット[2]  NM_001025400, NM_001035234

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR002999  Tudor domain
IPR018351  Tudor subgroup

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
10349636
10512203
10922068
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
14610273
15031102
15489334
15840001
16141072
16141073
16682971
17967808
18287559
18799693
21267068
21677750

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006915  apoptosis
GO:0008150  biological_process
GO:0006397  mRNA processing
GO:0008380  RNA splicing

Cellular Component

GO:0005575  cellular_component
GO:0005737  cytoplasm
GO:0005634  nucleus
GO:0005681  spliceosomal complex

Molecular Function

GO:0003674  molecular_function
GO:0003723  RNA binding