matrix metallopeptidase 1b (interstitial collagenase)

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同義遺伝子名

Mmp1b, MMP-1b, Interstitial collagenase B precursor, McolB, Mcol-B, Matrix metalloproteinase-1b, Mcolb

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:- 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
GeneChip 大脳:3.64 小脳:3.71 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:3.58 脊柱:3.81 網膜:3.70 目:3.87 動脈:- 静脈:3.73 リンパ節:3.69 末梢血:- 脾臓:3.51 胸腺:- 骨髄:3.77 脂肪:3.62 骨:3.64 皮膚:3.73
CAGE nodata
RNA-seq nodata
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:3.62 胎盤:3.76 前立腺:3.56 卵巣:3.67 精巣:3.83 心臓:3.85 骨格筋:3.69 食道:- 胃:3.65 腸:3.65 結腸:- 肝臓:4.13 肺:3.55 膀胱:3.60 腎臓:3.61 下垂体:3.63 甲状腺:- 副腎:3.50 膵臓:4.33 乳腺:3.70 唾液腺:3.76
CAGE nodata
RNA-seq nodata

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_032007
Gene ID 83996
Unigene ID Mm.379271
Probe set ID 1422273_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000041620

オーソログ対応遺伝子

ヒト[2]  NM_001145938, NM_002421
ラット[1]  NM_001134530, NM_002421

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR006026  Peptidase, metallopeptidases

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

11113146
11544199
12815621
16236725
17307908
18267097
19853894

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0030574  collagen catabolic process
GO:0008152  metabolic process
GO:0006508  proteolysis

Cellular Component

GO:0005581  collagen
GO:0031012  extracellular matrix
GO:0005576  extracellular region
GO:0005578  proteinaceous extracellular matrix

Molecular Function

GO:0005509  calcium ion binding
GO:0016787  hydrolase activity
GO:0046872  metal ion binding
GO:0004222  metalloendopeptidase activity
GO:0008237  metallopeptidase activity
GO:0008233  peptidase activity
GO:0008270  zinc ion binding