SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 1

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同義遺伝子名

ATP-dependent helicase SMARCA1, Probable global transcription activator SNF2L1, Snf2l, DNA-dependent ATPase SNF2L, Smarca1, 5730494M04Rik, Nucleosome remodeling factor subunit SNF2L

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:41.70 小脳:36.80 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:19.10 脊柱:- 網膜:32.10 目:45.60 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:12.50 皮膚:7.90
GeneChip 大脳:8.12 小脳:6.35 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:7.82 脊柱:6.26 網膜:7.71 目:7.70 動脈:- 静脈:8.89 リンパ節:4.44 末梢血:- 脾臓:5.16 胸腺:- 骨髄:5.05 脂肪:5.71 骨:5.94 皮膚:5.28
CAGE 大脳:2.34 小脳:- 脳幹:2.40 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:2.11 網膜:- 目:- 動脈:0.89 静脈:- リンパ節:0.57 末梢血:- 脾臓:0.29 胸腺:0.82 骨髄:- 脂肪:- 骨:1.30 皮膚:0.77
RNA-seq 大脳:0.96 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:174.50 胎盤:27.60 前立腺:- 卵巣:46 精巣:7.40 心臓:37.20 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:-    膀胱:- 腎臓:16.10 下垂体:38.80 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:18.80 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:5.94 胎盤:6.60 前立腺:5.19 卵巣:10.25 精巣:6.44 心臓:5.43 骨格筋:6.45 食道:- 胃:5.45 腸:5.08 結腸:- 肝臓:5.13 肺:4.88 膀胱:6.04 腎臓:5.35 下垂体:8.43 甲状腺:- 副腎:9.69 膵臓:5.85 乳腺:5.86 唾液腺:5.79
CAGE 子宮:1.58 胎盤:1.81 前立腺:0.63 卵巣:4.77 精巣:2.68 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:1.07 腸:0.42 結腸:0.57     肝臓:0    肺:0.55 膀胱:1.08 腎臓:- 下垂体:3.02 甲状腺:- 副腎:3.79 膵臓:1.84 乳腺:0.92 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:1.32 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:0        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_053123
Gene ID 93761
Unigene ID Mm.229151
Probe set ID 1460292_a_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000031099

オーソログ対応遺伝子

ヒト[6]  NM_003069, NM_139035
ラット[6]  NM_003069, NM_139035

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR014001  DEAD-like helicase, N-terminal
IPR014021  Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain
IPR009057  Homeodomain-like
IPR012287  Homeodomain-related
IPR001005  SANT, DNA-binding

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10349636
10922068
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16141073
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18425126
19996304
20059953
20211142
21267068
21677750
22516202
23616592
24457600

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0043044  ATP-dependent chromatin remodeling
GO:0007420  brain development
GO:0016568  chromatin modification
GO:0006338  chromatin remodeling
GO:0000733  DNA strand renaturation
GO:0030182  neuron differentiation
GO:0045893  positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0000790  nuclear chromatin
GO:0005634  nucleus
GO:0016589  NURF complex

Molecular Function

GO:0005524  ATP binding
GO:0003682  chromatin binding
GO:0003677  DNA binding
GO:0008094  DNA-dependent ATPase activity
GO:0004386  helicase activity
GO:0016787  hydrolase activity
GO:0016817  hydrolase activity, acting on acid anhydrides
GO:0016818  hydrolase activity, acting on acid anhydrides, in phosphorus-containing anhydrides
GO:0003676  nucleic acid binding
GO:0031491  nucleosome binding
GO:0070615  nucleosome-dependent ATPase activity
GO:0000166  nucleotide binding